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数量遗传学理论框架下的进化生态学研究: 以动物模型的运用为例

已有 2002 次阅读 2018-3-28 17:07 |个人分类:文献解析|系统分类:科研笔记

王代平, 夏灿玮, 刘阳,等. 数量遗传学理论框架下的进化生态学研究:以动物模型的运用为例[J]. 动物学杂志, 2017, 52(4):690-701.

摘要

目前,生态学家越来越关注深入的生物学问题,例如,

  • 1)理解生态和进化过程的互作和关系;

  • 2)种群中一个重要的表型特征,受遗传基因影响多大?即其可遗传程度,表示该性状的进化潜能;

  • 3)基因是怎样影响表型性状,及其对应的个体适合度以及种群动态?

  • 4)决定多个重要表型性状的基因之间关系和互作如何?
    随着生物统计软件尤其是线性混合模型的发展,结合经典数量遗传学的理论,发展出了针对上述问题的动物模型(Animal Model),使得我们可以对野外种群进行上述研究.本文首先介绍了经典数量遗传学的重要概念,随后在其理论框架下,举例介绍了动物模型的操作和使用,最后探讨和展望了利用数量遗传学方法进行进化生态学研究的前景.

生态学为何使用动物模型(野生动物)

进入21世纪以来,随着分子生态学的发展,特别是亲本鉴定技术,加上计
算机庞大的统计和模拟计算能力(如贝叶斯统计),使得数量遗传学方法在野外进化生态学的运用成为可能。

数量遗传学的重要概念

  • 遗传力

  • 遗传相关

  • 重复力

混合线性模型相对于传统方法的优势

  • 经典的计算方法需利用特定的家系关系,如父母亲平均值-子代,而动物模型能整合各种亲缘信息,例如,祖父母与第三代关系、全胞( full-sibling ) 兄弟姐妹关系、半胞(half-sibling)关系、表亲关系等等

  • 混合线性模型(现代方法)该模型自动将研究种群的所有家系信息整合,存入到一个独立的空间,再和另一个所需数据文件(即该种群某个性状的表型值)整合

动物模型常用分析软件

其中asreml软件,分为asreml-w和asreml-r两个版本
software

动物模型的名称争议

动物模型不仅仅适用于动物研究,事实上,之所以叫动物模型,是因为该模型最早是在动物上使用。为了便于区分,同样的模型在林木或植物上,一般称为个体模型

点评

文章写得非常流畅,值的一读! http://dwxb.alljournals.net/ch/reader/create_pdf.aspx?file_no=16270&flag=1&journal_id=dwxb&year_id=2017 



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1 王代平

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