育种数据分析之放飞自我分享 http://blog.sciencenet.cn/u/yijiaobai 关注:生物统计,数量遗传,混合线性模型,生物信息,R,Perl,Python,GWAS,GS相关方法,文章及代码

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  • 北京康普森农业科技有限公司,育种数据分析师

    • 生命科学->遗传学与生物信息学->生物信息学

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总结 | R语言批量读取写入Excel数据 2021-06-19
前一段,写过一篇: R语言中写入Excel的不同sheet表格 ,最近学习了tidyverse的方法,感觉需要总结一下,更新一下知识结构。 本文准备用实际数据, ...
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一文讲清遗传相关 2021-06-18
一些育种的基本概念,需要看教科书理解一下。这次我学习教科书,加深对相关概念的理解,最后用实际数据演示一下如何计算遗传相关及显著性。 「参考书:」 ...
(438)次阅读|(0)个评论
tidyverse之汇总统计 2021-06-16
之前写过一篇博客,介绍R语言的 aggregate 函数的汇总统计,最近学习 tidyverse ,感觉更好用,对比学习一下。 1 模拟数据 这里模拟了4个因子,5个观测 ...
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通过代码理解中心化和标准化 2021-06-15
1. R中的方差和标准差 「方差: var ,是样本方差」 ❝ var(y) instructs R to calculate the sample variance of Y. In other words it us ...
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亲缘关系推断软件:king 2021-06-14
❝ 今天是端午节,放假了几天,除了分析一个紧急的项目,基本处于放空状态。没有工作,没有动脑。主要内容是遛娃,吃饭,睡觉。下午回来,放空几天的 ...
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R语言循环第三境界:purrr包map函数! 2021-06-10
1. 三境界 R语言写循环有 三境界 : 手动for循环 apply系列 purrr泛函式编程 其中,手动for循环我最常用,apply系列半吊子,purrr函数 ...
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混合线性模型的可视化 2021-06-05
1. 数据 这里使用 sleepstudy 数据集,看一下免费的R包 lme4 和付费包 asreml 如何处理不同的混合线性模型,以加深对混合线性模型的理解。 「数据描 ...
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混合线性模型的理解 | 学霸和富二代的故事 2021-06-05
富二代和学霸的故事 看一下 lmer 函数拟合混合线性模型的通用函数: 举个例子,在一个课堂上,小学六年级,班里面有30个学生,这些学生有一年级到五年 ...
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