博文
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用足当触角用，用触角当足用，用翅当足用的昆虫
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- 一个结构或器官，在其相应功能的发挥中如果性能强大，通常会让人们赞叹或惊讶。然而，如果一个结构被用来行使看上去并不相关的其他功能，是不是更令人感慨自然界的奇妙呢？ 用足当触角用 原尾目Protura的昆虫（广义）前足发达，常举起向头前伸出，看上去很像捕捉足的 ...
- 1996-2015的20年间主要序列分子标记在系统发育重建中的使用简况
- 2015年的分子标记使用格局发生了一个有意思的变化，线粒体基因的使用在经过之前的下降之后，重新开始上升，而核基因rDNA则连续第二年下降，线粒体基因的使用频率首次高于核基因rDNA（图1）。不过如果考虑历史上已经形成的数据积累，核基因rDNA已有的数据量可能仍然是最多的。 ...
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从生物进化看AlphaGo和人工智能
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- 2016年3月9日，被谷歌收购的英国DeepMind公司的人工智能围棋软件AlphaGo在与韩国围棋职业九段李世石的五番棋较量中以1:0领先，吸引了全世界的目光。在3月10日，更是扩大战果以2:0领先；如果说1天之前专业棋手和非专业人士对AlphaGo的胜利还觉得持保留态度的话，那么在3月10日已经普遍认可了这款软件 ...
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昆虫中最特化的翅
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- 昆虫是地球上最早开始具有飞行构造的动物。虽然说昆虫的飞行主要依靠胸部在横截面的形变而不是翅本身（因为不像脊椎动物的翅有骨骼和肌肉，再加上飞行运动中相对较低的雷诺系数 Reynolds number ，所以是一个并不容易拉动的杠杆），但是昆虫的翅仍然是一个足够神奇的构造。 & ...
- rRNA二级结构中的分子独征在系统发育重建中的应用--澳丝蝽科案例
- 对于分类学实践来说，比较理想的分类特征应该在各子类群之间可以被明显区分为不同类型（间断变异）、而在各子类群内部为同一种类型（状态稳定），如果该特征还与近缘关系直接关联（衍征apomorphy，甚至是独征autapomorphy）而不只是表面相似（非同源相似homoplasy、趋同convergence），那就更 ...
- 半翅目蝽总科中首次发现拟蚁种类
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- 在2014年以前，蝽类昆虫中包含拟蚁种类的科有10个，分别是奇蝽科Enicocephalidae、跳蝽科Saldidae、盲蝽科Miridae、姬蝽科Nabidae、红蝽科Pyrrhocoridae、大红蝽科Largidae、蛛缘蝽科Alydidae、地长蝽科Rhyparochromidae、大眼长蝽科Geocoridae、尖长蝽科Oxycarenidae。其中比较常见的是盲蝽 ...
- 不完全列举那些远离一国本土的岛礁
- 远离一国本土的岛或礁，美国、英国、法国都有很多，散布在北大西洋、南大西洋、印度洋、太平洋等大洋。日本也有一些，例如南鸟岛（Minami Torishima，也叫马库斯岛Marcus Island）。中国南海的很多岛礁也在国际传媒的大量报道中越来越受人关注，其中部分岛礁远离本土。不过除了这些，其实还有 ...
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系统发育重建中主流算法的未来走向
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- 系统发育重建中会被使用到的算法大体包括最大简约法(maximum parsimony, MP)，非加权组平均法(unweighted pair-group method with arithmetic means, UPGMA)，邻接法（neighbor-joining method, NJ），最小进化法(minimum evolution, ME)，最大似然法(maximum likelihood, ML)，贝叶斯推断(Bayesian ...
- 基于GPU流处理单元的MrBayes并行加速
- 随着用于分子系统发育推断数据量的增大，尤其是基于基因组和转录组的大数据时代的来临，越来越多研究者面临计算周期延长的挑战，因此人们提出了一些通过并行计算进行加速的解决方案。其中最典型的要数基于多CPU的解决方案，这种解决方案出现的时间最早、最成熟，目前也都受主流系统发育重建软件的支 ...
- 分歧时间研究中用作标定的化石所处的层位时间
- 随着越来越多较为可靠的系统发育框架的出现，很多研究者都在进行分歧时间推断的分析，这其中需要对某些节点进行分歧时间标定，基于已知推断未知。在大多数情况下，时间标定还是以化石为主，尤其是对高级阶元系统发育而言。在Paleobiology Database中（ https://paleobiodb.org/cgi-bin/bridge.pl?a= ...
