随着越来越多较为可靠的系统发育框架的出现，很多研究者都在进行分歧时间推断的分析，这其中需要对某些节点进行分歧时间标定，基于已知推断未知。在大多数情况下，时间标定还是以化石为主，尤其是对高级阶元系统发育而言。在Paleobiology Database中（https://paleobiodb.org/cgi-bin/bridge.pl?a=displayDownloadGenerator），研究者们可以很方便地找到目标化石所处的层位时间。

      这些层位时间信息可以直接使用么？事实上，数据库并不保证所列时间的客观性，而是多来自于原始文献。这里就会存在一个问题，其实化石能被比较有把握确定的是层位信息，而与层位相对应的时间界限是在持续修订的。如果持续关注不定期更新的国际地质年表International Chronostratigraphic Chart（http://www.stratigraphy.org/index.php/ics-chart-timescale），就会发现有些层位时间界限存在不同幅度的修订。因此，最妥善的处理方式是，在选定化石之后，基于最新的国际地质年表中的层位时间信息在BEAST等分歧时间推断软件中进行时间标定的设置。当然，考虑到国际地质年表中层位时间的修订幅度一般都不是很大，所以如果直接使用Paleobiology Database中所显示的层位时间信息的话，应该对于分歧时间推断结果影响非常有限。