miRNA分享 http://blog.sciencenet.cn/u/spfeng321

博文

橡胶树基因组情况

已有 2556 次阅读 2019-1-27 18:44 |个人分类:橡胶|系统分类:科研笔记

橡胶树基因组情况:

橡胶树是大乔木,高可达30米;树皮形成层组织有丰富胶乳,正确割胶方法采集可不断产生新胶乳;指状复叶有3片小叶;实生树经济寿命30-50年,芽接树经济寿命15-20年,整株树寿命约60年;花期在5-6月份;种子和树叶误食有毒,属有毒植物

染色体数目:18对,2n=36

基因组大小:即C值约2G

基因数:42254

蛋白质数:57978

rRNA:8

tRNA:550

miRNA30miRBase release22


基因组测序情况见下表:

 

BioProject

Institute

Genom Size(Gb)

strain

Scaf

N50

Scaf No

Contig

N50

Publiction year

Pubmed ID

PRJNA3004386

MGI, Malaysia

2.15

RRIM600

2.97

608,017

1.26

2013

23375136

PRJNA394253

CATAS, China

1.46

RY73397

1,280

7,453

30.6

2016

27255837

PRJDB4387

Riken, Japan /USM, Malaysia

2.15

RRIM600

67.24

189,316

20.75

2016

27339202

PRJDB4987

BIOTEC, Thailand

1.26

BPM24

96.8

592,579

1.3

2016

28150702




https://blog.sciencenet.cn/blog-105435-1159384.html

上一篇:橡胶树相关数据库
下一篇:橡胶树相关书籍
收藏 IP: 122.188.146.*| 热度|

0

该博文允许注册用户评论 请点击登录 评论 (0 个评论)

数据加载中...

Archiver|手机版|科学网 ( 京ICP备07017567号-12 )

GMT+8, 2024-5-16 02:09

Powered by ScienceNet.cn

Copyright © 2007- 中国科学报社

返回顶部