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近期完成对水稻纹枯病菌蛋白质互作网络构建与预测及相关工作:
1、使用同源映射法和结构域相互作用的方法预测水稻纹枯病菌的蛋白质互作网络图。运用果蝇、线虫、人类、酵母蛋白实验互作网络数据,通过整合两种预测方法的重叠数据(同源映射中Inparanoid算法的可信度分值大于0.5) 构建含1,773个蛋白的6,705对互作蛋白网络。
2. 通过GO注释、基因共表达和酵母双杂交方法评估纹枯病菌蛋白质互作网络具有较高可信度。
3. 对PHI、分泌蛋白、水解酶、信号传导网络中Core基因进行互作分析,预测到互作致病功能候选基因。
4. 比较Necrotroph 和Biotroph 病原菌的互作模式,发现与致病相关的差异互作调控。
5. 从网络中验证到与致病密切相关的预测转录因子。
相关内容近期发表在:J. Proteome Res. http://pubs.acs.org/doi/abs/10.1021%2Fpr500069r
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