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[转载]Poultry Science||（二区）基于不同绿蛋壳颜色强度的长顺绿壳蛋鸡肝脏转录组和代谢组的比较分析

已有 259 次阅读 2026-8-14 16:56 |系统分类:论文交流|文章来源:转载

禽蛋壳色主要由胆绿素和原卟啉决定，但肝脏如何调控绿壳深浅仍不清楚；本研究对长顺绿壳蛋鸡深绿蛋（DG）与浅绿蛋（LG）个体肝脏同时进行转录组与代谢组比较，共鉴定 350 个差异表达基因（DEG）与 211 个差异代谢物（DAM），GSEA 显示 DEG 富集于能量、免疫、营养代谢，MSEA 显示 DAM 富集于氨基酸、维生素、胆汁酸与脂质代谢，基因-代谢物互作网络锁定一个以黑色素代谢转运为核心的子网络，提出 CDKN2B、DDC、PYCR1、ABCG5、SLC3A1、P2RX2 等 6 个候选基因及血清素、5-HIAA、鸟氨酸、乙酰胆碱、L-色氨酸等 7 个候选代谢物参与调控，结论认为肝脏黑色素代谢/转运及机体能量-免疫-抗氧化-胆汁酸状态间接影响胆绿素分配至蛋壳，从而决定绿壳强度。

1题目

文章题目：Comparative analysis of hepatic transcriptomes and metabolomes of Changshun green-shell laying hens based on different green eggshell color intensities

发文单位：

黔南民族师范学院生物科学与农学院
黔南州畜禽应用生物技术重点实验室
浙江大学动物科学学院
黔南民族师范学院图书馆
贵州长顺天农绿壳蛋鸡实业有限公司

研究对象：45 周龄贵州长顺绿壳蛋鸡母鸡肝脏组织

研究领域：家禽分子育种 / 蛋品质性状遗传机理 / 肝脏转录组-代谢组联合分析 / 色素沉积与抗氧化生理（农业动物科学）

2杂志Poultry Science； IF=4.7分

3链接

Xu, W., Mu, R., Gegen, T., Luo, J., Xiao, Y., Ou, S., Wu, Q., Zuo, Y., Chen, Z., & Li, F. (2024). Comparative analysis of hepatic transcriptomes and metabolomes of Changshun green-shell laying hens based on different green eggshell color intensities. Poultry Science, 103, 103220. https://doi.org/10.1016/j.psj.2023.103220

4检测方法

Norminkoda提供了qPCR检测5主要内容

分组与表型：用 NH310 色差仪测 CIE L/a/b/C/h，DG 组 a 更负（−8.33 vs −1.03）、h* 更高，确认深绿表型稳定。

转录组：Illumina NovaSeq 6000，比对 Gallus gallus GRCg7b，DESeq2 筛 350 DEG（147 上/203 下）；富集到 TCA 循环、细胞因子受体、TLR、JAK-STAT、氨基酸合成等。
代谢组：UPLC-TripleTOF，PLS-DA 模型 Q²=0.971；211 DAM（24 上/187 下）；富集到色氨酸、精脯氨酸、维 B6、初级胆汁酸、甘磷脂代谢等。

联合网络：STITCH 构建获 1 个子网络（12 基因+9 代谢物），ADP 连接度最高、鸟氨酸中介中心性最高，节点多指向黑色素合成（DDC 血清素通路、ABCG5 转运、PYCR1 脯氨酸促黑）。

qPCR 验证：随机挑 8 基因（含 SLCO1B3、PLIN1、UCHL1 等），趋势与 RNA-seq 一致。

否定假设：肝中胆绿素含量两组无差、未检出原卟啉，已知子宫 SLCO1B3/ABCG2 通路在肝中未现差异 → 肝不是色素合成场所，但是“生理状态调度中心”。

主要结论：

肝脏不直接合成胆绿素/原卟啉，但通过黑色素代谢与抗氧化缓冲间接放大蛋壳绿度。
深绿蛋鸡肝脏呈现：更活跃的黑色素相关节点 + 更强 TCA/能量供给 + 胆汁酸合成偏强（利于胆绿素肠肝循环回流）+ 免疫/抗氧化基调不同。
给出 6 基因 7 代谢物候选集，可作为绿壳强度分子标记选育的备选。
生产上：营养、氧化应激、肝胆健康、免疫负荷都会“偷走”胆绿素分配，导致绿壳变浅。

6总结

视角新：前人盯子宫/壳腺 SLCO1B3、ABCG2；本文把镜头切回肝脏作为全身状态枢纽，解释“同品种同基因型下为什么有的鸡下深绿、有的下浅绿”——答案是生理状态分流，不是色素基因开关。

方法学稳：转录+代谢双组学交叉、PLS-DA Q²>0.95、qPCR 回补，农村地方院校团队完成度不错。
机制链：胆绿素本身是血红素分解产物、具抗氧化性 → 母鸡若自身氧化压力大，胆绿素被“自用”不掉到蛋壳 → 肝里黑色素代谢+胆汁酸循环+能量盈余越高，越多胆绿素被允许“溢”到子宫沉积 → 蛋越绿。
应用指向：长顺绿壳鸡消费者偏爱深绿，选育不能只选 SLCO1B3，还要看肝代谢健康相关标记（如 ABCG5、DDC、胆汁酸通路）；饲料端抗氧化+利胆+氨基酸平衡可能提绿度。