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在线绘制venn图+柱状图组合图

已有 384 次阅读 2026-6-30 10:18 |系统分类:科研笔记

导读:venn+bar组合图,上半部分用venn图梳理数据集之间的交集情况,下半部分用柱状图直接展示各数据集的元素总数。逻辑与数据分离呈现,互不干扰,却互为补充。学会这一招,你的数据可视化瞬间提升一个专业层级。fig1.jpg

图1. Venn+bar组合图

《Cell》期刊Evolution and genetic adaptation of fishes to the deep sea.fig 2H使用venn+bar组合图展示了在深海模型(deep-sea model) 深渊模型(hadal model) 下,同时发生趋同选择(convergent selection) 正选择(positive selection) 的基因数量。上半部分是venn图,下半部分是每个数据集的基因数。Bar的颜色和venn数据集的颜色一一对应,清晰明了。顶级期刊的图表风格有一个共同趋势:越来越少依赖图例,越来越多依赖直接的颜色编码颜色对应关系越直接,图表的信息传达效率就越高。

1,打开作图URL

https://www.bioinformatics.com.cn/plot_basic_venn_diagram_and_bar_plot

fig2.png

图2.绘图页面

2,示例数据

点击图片上方的示例数据,下载,并使用excel打开。fig3.png

图3. 示例数据

示例数据包括4列,每一列是一个数据集,其中第一行是数据集的名字,剩余行是数据集中的元素。默认会去掉每个单元格两侧的空白,并且大小写敏感。

此模块支持2-7个数据集。

3,输入检查

示例数据:点击输入框下面的“示例”按钮,将载入示例数据。

真实数据:数据放在excel中,调整好后,Ctrl+A选中数据,Ctrl+C拷贝,Ctrl+V将数据粘贴到输入框中。fig4.png

图4. 载入数据,输入检查

然后使用输入框下面的“输入检查”按钮先对输入数据进行检查。若检查不通过,请根据检查提示重复【修改-输入检查】步骤,直到检查通过(如下图所示),然后可以继续选择其他参数。

fig5.png

图5.输入检查结果

注:输入检查是新添加的功能,它会根据不同模块的输入要求,逐行逐列检查输入数据,并给出提示,以确保数据符合模块输入要求。建议每次提交前先进行输入检查

4,选择参数fig6.png

图6.绘图参数

图片大小:图片宽度,图片高度参数

Bar和venn颜色

提供了7种自定义颜色,支持2到7个数据集的venn图。

新加功能:解决配色难题

1,颜色集:提供了7种常见期刊的颜色集,点击后,在该论文的颜色集中随机挑选

2,随机颜色:点击“随机”按钮后,会随机推荐7种颜色,点击一次,随机一次

3,自定义:可以粘贴空格分隔的16进制颜色编号,例如 #E64B35 #4DBBD5 #00A087 

Venn相关

设置了venn和bar的透明度

Venn数据集字体大小,来自输入的第一行

Venn各部分数字字体大小,venn中不同部分所标注的数值的字体大小

bar文字及字体大小

bar上方数据集元素个数字体大小:控制bar上方每个数据集元素个数的数值的字体大小

bar X轴数据集名字体大小:bar的X轴每个bar对应的数据集的名字的字体大小

bar Y轴刻度数字字体大小:bar的Y轴数值刻度的字体大小

bar Y轴说明:bar的Y轴上方Gene number文字说明

bar Y轴说明字体大小:bar的Y轴上方Gene number字体大小 

bar宽度和大小

bar宽度(控制每个bar的宽度):值越小,bar越细

bar X轴数据集名旋转角度:数据集名字旋转角度以避免文字重叠

bar相对于venn的高度(越小,bar越矮)

bar顶部位置(值越大,bar越往上)

bar图左右留白(值越大,整个bar越窄):用来控制下面bar的整体宽度,以与venn图宽度相匹配

venn是否椭圆

当有4个或者5个数据集时,选择是否用椭圆展示。2个或者3个数据集时还是用圆圈。 

字体:

设置了期刊杂志中最常用的两种字体:Times New Roman和Arial。如需使用其他字体,可以下载pdf或者svg图片,然后使用acrobat illustrator或者inkscape进行编辑修改

5,提交出图

检查通过,并且参数选好后,点击“提交”按钮,约3s后,会在页面上显示venn+bar预览图。我们提供了pdf、svg两种矢量图,png、tiff两种标量图供大家下载使用。fig7.png

图7.预览图

请使用Acrobat Illustrator,inkscape等软件编辑矢量图(pdf或svg),进行组图,调整文字、图像元素位置,字体,添加说明等操作,以满足个性化需求。

同时提供了每个部分的表格供下载。

fig8.png

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