近期，中国农业科学院北京畜牧兽医研究所猪遗传育种创新团队王立贤研究员团队完成的题为“Genome-wide association studies of novel resilience traits identify important immune QTL regions and candidate genes in Duroc pigs”的研究在Journal of Integrative Agriculture（JIA）2025年11期正式发表。

恢复力是指动物在受到干扰时受到最小程度的影响，或迅速恢复到受干扰前的状态的能力。本研究通过自动测定设备收集的90—180日龄猪的采食量、摄食行为和体重数据，利用普通最小二乘的均方误差根和分位数回归的负残差两种方法进行评价猪的恢复力性状。

构建4种新的恢复力性状，其基因组遗传力在0.09—0.41，遗传相关性和表型相关性分别为0.16—0.95和0.05—0.36。通过单性状和双性状的混合线性模型两种模型共鉴定27个SNPs与这些恢复力性状显著相关。它们分布位于9条染色体上（SSC1、SSC2、SSC6、SSC7、SSC8、SSC12、SSC14、SSC16和SSC17）。

注释到39个QTLs和49个候选基因，其中存在与功能相关的候选基因，包括OTUD4、TIFA和CARD14，它们参与宿主免疫反应、疾病易感性和信号转导。在15个组织的GWAS和eQTL分析中发现了8个独特的SNP存在因果关系。值得注意的是，一个SNP（rs80794541）与七种组织/细胞类型（包括巨噬细胞类型）中同时鉴定的eQTL相关。此外，4个显著SNP（rs81467127、rs81356029、rs80794541和rs81305085）与引物增强子、活性元件和启动子的功能相关。利用猪成纤维细胞HiC数据，发现SSC2上的SNP（rs81356029）调控CARNS1和SSH3，SSC7上的SNP（rs80794541）调控H2AC6。

该团队在杜洛克猪群体中产生了4种新的恢复力性状，并确定了与这些恢复力性状显著相关的SNP。GWAS信号与参与免疫性状的候选基因和关键的调控元件有关。该研究的发现将有助于阐明遗传机制，并为进一步研究家猪的恢复力提供信息。

中国农业科学院北京畜牧兽医研究所王立贤研究员和赵福平研究员为该文的通讯作者，硕士研究生李棉燕为该文的第一作者。该研究得到国家重点研发计划项目（2024YFF1000100和 2021YFD1301102)、国家自然科学基金（32172702）和中国农业科学院创新项目（ASTIP-IAS02）等项目资助。

论文信息：Mianyan Li, Lei Pu, David E. MacHugh, Jingjing Tian, Xiaoqing Wang, Qingyao Zhao, Lijun Shi, Hongmei Gao, Ying Yu, Lixian Wang, Fuping Zhao. 2025. Genome-wide association studies of novel resilience traits identify important immune QTL regions and candidate genes in Duroc pigs. Journal of Integrative Agriculture, 24(11): 4355-4369.

https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S2095311924001746 

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