随着现代农业全面步入基因组学时代，高通量单核苷酸多态性（SNP）阵列已成为一项不可或缺的基因分型工具，显著加速了育种进程并推动了基础研究的深入。然而，冬瓜作为我国重要的蔬菜作物，虽种植面广、资源丰富，却长期缺乏专用的高通量分型平台，这严重制约了其分子育种的发展。与此同时，市场对高品质鲜食与加工专用型冬瓜的需求日益多元。面对传统育种周期长、效率低的瓶颈，亟需一款精准高效的现代化育种工具，以加速培育抗病强、品质优且满足专用需求的冬瓜新品种。

近期，湖南省蔬菜研究所冬瓜团队完成的题为“A new 10K liquid SNP genotyping array for wax gourd and its application in heterosis utilization and cultivars identification”的研究在Journal of Integrative Agriculture (JIA) 2026年2期正式发表。

该研究基于靶向测序基因分型（GBTS）技术，成功开发了包含10,722个SNP位点的冬瓜液相芯片，这些位点均匀分布于全部12条染色体，并整合了278个与重要农艺性状相关的功能标记。

为验证该芯片的应用价值，研究团队开展了系统分析，具体包括三个关键应用：通过对19个优良自交系的分析，证实了基于芯片数据计算的遗传距离与单果重的杂种优势显著相关，为杂交亲本的优化选配提供了关键依据；通过对56个主流品种的基因分型，成功解析了其群体遗传结构，将品种划分为两大类，并揭示了不同皮色类群间的遗传多样性差异；利用筛选出的60个多态性SNP，为56个品种构建了独特的DNA指纹图谱，为品种权保护与市场管理奠定了坚实的技术基础。

该芯片的推出，为冬瓜分子育种从理论研究走向田间应用提供了关键性技术支撑。作为国际首款冬瓜液相育种芯片，它不仅构建了完整的基因分型技术体系，更将在提升育种效率、强化品种管理和推动产业升级等方面产生深远影响。

湖南省蔬菜研究所刘丹博士和谢玲玲副研究员为论文的共同第一作者，弭宝彬副研究员和湖南农业大学武芳芳副教授为论文的共同通讯作者。本研究得到了湖南省种业创新项目、湖南省农业科技创新资金项目和湖南省科协人才项目的资助。

论文链接：https://doi.org/10.1016/j.jia.2025.11.010

Cite this article: Dan Liu, Lingling Xie, Yuting Lei, Bingchuan Tian, Daolong Liao, Fangfang Wu, Baobin Mi. 2026. A new 10K liquid SNP genotyping array for wax gourd and its application in heterosis utilization and cultivars identification. Journal of Integrative Agriculture, 25(2): 734-743.

Journal of Integrative Agriculture（《农业科学学报（英文）》, JIA）由中华人民共和国农业农村部主管，中国农业科学院与中国农学会主办，中国农业科学院农业信息研究所承办。综合性英文学术期刊，月刊。创刊于2002年，现任主编为中国科学院院士陈化兰。JIA主要栏目有作物科学、园艺、植物保护、动物科学、动物医学、农业生态环境、食品科学、农业经济与管理等。刊稿类型有综述、研究论文、简报以及评述等。全部论文在Elsevier-ScienceDirect (SD) 平台OA出版。最新SCI影响因子4.4，位于SCI-JCR农业综合学科Q1区。中国科学院分区农林科学1区。2016年以来先后获得中国科协等部委 “提升计划”“登峰计划”“卓越计划”项目支持。