菜用大豆（毛豆）凭借鲜嫩口感与丰富营养，成为国民喜爱的优质蔬菜，荚果大小、色泽等外观品质直接决定市场售价与消费者选择。

近期，江苏省农业科学院、南京农业大学等单位联合攻关，在菜用大豆外观品质遗传研究领域取得重要进展，完成的题为“Genome-wide association study of appearance quality traits and development of KASP makers in vegetable soybean”的研究在Journal of Integrative Agriculture（《农业科学学报（英文）》，JIA）2026年6期发表。该研究基于全基因组关联分析（GWAS）精准定位关键位点，开发出可直接用于分子育种的KASP功能标记，为优质毛豆新品种选育装上“基因导航”。

该研究团队选取264份菜用大豆种质，在江苏南京、南通、淮安3地开展多年多点试验，利用PlantPhenoM豆荚表型智能鉴定系统，精准测定荚长、荚宽、荚色3大核心外观性状。结果显示，不同材料外观品质变异系数8.64%–30.00%，遗传多样性丰富；基因型、环境及二者互作均对毛豆外观产生显著影响，为后续基因定位奠定坚实基础。

依托高密度SNP图谱与全基因组关联分析，研究团队共检测到525个与菜用大豆外观品质显著关联的SNP位点，覆盖荚长、荚宽、荚色三大性状。

团队围绕核心位点进行局部连锁不平衡分析，在显著SNP上下游120 kb区间内，筛选出5个调控豆荚外观的关键候选基因，分别参与细胞伸长、细胞壁合成、油菜素内酯信号通路等生物学过程，从分子层面揭示毛豆荚果大小与色泽的调控机制。

为将基础研究转化为育种工具，团队针对3个主效SNP位点成功开发KASP分子标记：

 ·S04_372771：精准鉴定菜用大豆荚长

·S18_51477324：高效分型荚宽性状

·S18_55553200：快速筛选优质青荚材料试

验验证表明，3个标记均可清晰区分基因型，实现“一次检测、快速选种”，大幅缩短育种周期、提升选择精度，让“大荚、宽荚、翠绿荚” 优质毛豆培育更高效。

江苏省农业科学院/生物育种钟山实验室陈华涛研究员和南京农业大学朱月林教授为共同通讯作者，杨硕和贾倩茹（现为扬州大学讲师）为共同第一作者。该研究得到了生物育种钟山实验室（ZSBBL-KY2023-03）、江苏省自主创新资金（CX(22)5002）及中国博士后基金（2023M731401）等项目的资助。

Cite the article:

Shuo Yang, Qianru Jia, Qiong Wang, Junyan Wang, Jiahao Li, Shengyan Hu, Wei Zhang, Hongmei Zhang, Ya Guo, Xin Chen, Yuelin Zhu, Huatao Chen. 2026. Genome-wide association study of appearance quality traits and development of KASP makers in vegetable soybean. Journal of Integrative Agriculture, 25(6): 2341-2352.

https://doi.org/10.1016/j.jia.2024.09.005    

Journal of Integrative Agriculture（《农业科学学报（英文）》, JIA）由中华人民共和国农业农村部主管，中国农业科学院与中国农学会主办，中国农业科学院农业信息研究所承办。综合性英文学术期刊，月刊。创刊于2002年，现任主编为中国科学院院士陈化兰。JIA主要栏目有作物科学、园艺、植物保护、动物科学、动物医学、农业生态环境、食品科学、农业经济与管理等。刊稿类型有综述、研究论文、简报以及评述等。全部论文在Elsevier-ScienceDirect (SD) 平台OA出版。最新SCI影响因子5.7，位于SCI-JCR农业综合学科Q1区。中国科学院分区农林科学1区。2016年以来先后获得中国科协等部委 “提升计划”“登峰计划”“卓越计划”项目支持。

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