猪繁殖与呼吸综合征（PRRS，俗称猪蓝耳病）始终是制约全球养猪业发展的“顽疾”。在复杂的谱系演变中，NADC34-like 毒株（Lineage 1.5）以其极高的重组频率和多变的致病性，近年来已成为我国乃至全球防控监测的重中之重。尽管这类毒株在田间表现出极强的扩张性，但其在全球视野下的重组轨迹如何、不同国家间是否存在演化差异，长期以来缺乏标准化的分类框架和深度时空剖析。

近期，扬州大学兽医学院李向东教授团队完成的题为“Genetic diversity and recombination analysis of NADC34-like porcine reproductive and respiratory syndrome viruses”的研究在Journal of Integrative Agriculture（《农业科学学报（英文）》，JIA）优先在线发表。

该研究通过对176条来自NCBI公共数据库的NADC34-like PRRSV全基因组序列的深度挖掘，首次构建了涵盖12种重组模式的分类体系，并捕捉到了中国毒株重组热点发生的关键演化位移。

• 全球视野下的重组版图：R1-R12模式的建立

研究团队依托1,598条PRRSV全基因组背景库，精准锁定了来自中国、美国和韩国的176条NADC34-like高质量序列。研究发现，虽然该谱系毒株内部分类特征明确（组内距离 5.68%），但其重组形式却极其复杂。

通过对全基因组重组特征的系统梳理，研究人员首次界定了12种重组模式（R1-R12）。其中，NADC34-R1是目前美国的优势重组模式，展现出显著的地理聚集特征；而中国毒株则呈现出更加多元化、碎片化的重组格局，反映了复杂的流行背景。

图1 基于全基因组分析的NADC34-like PRRSV进化特征与R1-R12重组模式图

• 演化“引擎”：Lineage 1.8驱动的多样性增长

重组不仅是病毒逃避宿主免疫的手段，更是其获取生存优势的关键途径。研究数据揭示，在所分析的NADC34-like亚群中，重组毒株的比例已高达56.82%。

在众多的重组参与者中，Lineage 1.8（即NADC30-like谱系）被证实是驱动NADC34-like遗传多样化的“核心供体”。在全球范围内，超过54%的重组事件均有L1.8谱系的参与。这种基因交换模式，如同为病毒安装了高效的演化引擎，使其能迅速吸纳其他毒株的遗传优势，增加了防控的难度。

图2 NADC34-like PRRSV次要亲本谱系贡献率及重组频率分析

• 趋势位移：中国毒株独特的时空演化路径

不同于美国和韩国毒株重组热点长期稳定在ORF1ab区域，研究人员敏锐捕捉到了中国毒株在时间轴上的“演化位移”：

2017-2019年：中国毒株的重组主要集中在编码结构蛋白的区域（ORFs 2-7）；

2020年以后：重组热点显著向ORF1a区域转移。

这种从结构基因向非结构基因区转移的趋势，揭示了NADC34-like毒株在我国养殖环境和免疫选择压力下，正在经历深度的适应性改造。这一发现不仅为病毒的流行病学溯源提供了新线索，也为未来针对性疫苗的设计提供了关键靶区提示。

图3 中、美、韩三国毒株重组热点的时空动态对比

本研究不仅为NADC34-like PRRSV提供了全球统一的分类参考（R1-R12），更通过对中国毒株重组规律的深度刻画，强调了全基因组监测在蓝耳病防控中的核心地位。研究结果提示，防控NADC34-like毒株不能“孤军作战”，必须兼顾对其核心重组亲本（如L1.8谱系）的净化，并根据重组热点的位移及时调整分子诊断与监测策略。

扬州大学兽医学院博士研究生叶正琴为论文第一作者，李向东教授为通讯作者。本研究得到了国家自然科学基金国际（地区）合作与交流项目（NSFC-CGIAR）等项目的资助。

Zhengqin Ye, Wenqiang Wang, Zhenbang Zhu, Wei Wen, Hu Suk Lee, Xiangdong Li. 2026. Genetic diversity and recombination analysis of NADC34-like porcine reproductive and respiratory syndrome viruses. Journal of Integrative Agriculture, Doi:10.1016/j.jia.2026.01.006

https://doi.org/10.1016/j.jia.2026.01.006

Journal of Integrative Agriculture（《农业科学学报（英文）》, JIA）由中华人民共和国农业农村部主管，中国农业科学院与中国农学会主办，中国农业科学院农业信息研究所承办。综合性英文学术期刊，月刊。创刊于2002年，现任主编为中国科学院院士陈化兰。JIA主要栏目有作物科学、园艺、植物保护、动物科学、动物医学、农业生态环境、食品科学、农业经济与管理等。刊稿类型有综述、研究论文、简报以及评述等。全部论文在Elsevier-ScienceDirect (SD) 平台OA出版。最新SCI影响因子4.4，位于SCI-JCR农业综合学科Q1区。中国科学院分区农林科学1区。2016年以来先后获得中国科协等部委 “提升计划”“登峰计划”“卓越计划”项目支持。