肠道是一个高度区域化的器官，不同节段在解剖结构、微环境组成和免疫稳态方面存在显著差异，并对肠道病原体表现出不同程度的易感性和应答模式。然而，病原体感染后，宿主反应最早在哪一肠道节段被启动、由哪些关键细胞群驱动，以及这些局部反应如何在时空尺度上重塑肠道组织微环境，仍缺乏系统解析。

Spatially resolved single-cell transcriptome analysis of murine Salmonella infection reveals the role of distal colonocytes in the inflammatory response

作者：Dan Xu*, Ruifen Zhang, Shanshan Li, Can Guo, Chenglin Guan, Xiang Li, Mengyao Guo, Xin Xu, Yaxin Liu, Chenyi Mao, Peisen Sun, Xiaomin Dang, Diya Sun, Chengyao Wang, Stephen J. Bush* & Kai Ye*

DOI：10.1080/19490976.2025.2579909

研究结果

为回答这一关键科学问题，该研究以鼠伤寒沙门氏菌（Salmonella enterica serovar Typhimurium, S. Tm）诱导的小鼠肠炎模型为基础，整合 bulk RNA-seq、单细胞 RNA-seq 和空间转录组学数据，构建了结肠感染全周期的时空单细胞转录组图谱。

研究结果表明，远端结肠是宿主早期炎症反应和组织重塑的主要起始部位，其中远端结肠上皮细胞（distal colonocytes, DCCs）在感染早期表现出最强烈的转录响应，提示其可能是感知病原体损伤并启动局部免疫-基质反应的关键上皮细胞群。值得注意的是，在 DSS 诱导的结肠炎模型中，研究团队也观察到类似的远端结肠炎症富集现象，进一步提示远端结肠可能是多种肠道损伤和炎症反应中的优先响应区域。进一步通过跨物种整合人类肠道单细胞转录组数据，研究团队鉴定出一类与小鼠 DCCs 具有高度相似分子特征的人类结肠上皮细胞群，提示这一节段特异性上皮应答机制在人类肠道疾病中可能具有保守性。总体而言，该研究揭示了沙门氏菌感染中肠道节段特异性宿主反应的细胞与分子基础，强调远端结肠上皮细胞在感染早期组织响应中的核心作用，为理解肠道病原体损伤的空间选择性以及开发靶向肠道损伤和感染的新型干预策略提供了重要依据。

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