Volume  4  Issue  5

封面解读

刘陌/郑淇

Since the early 20th century, Drosophila has been a central model for research including genetics, immunity, and evolution. However, most available resources focus on Drosophila melanogaster, which limits the understanding of how key biological mechanisms are conserved or diversified. A unified multi-omics platform is important for revealing both conserved functions and species-specific innovations. We therefore developed DrosGB, an integrated database for 35 Drosophila species that combines genomes, 876 transcriptomes, approximately 420,000 predicted 3D protein structures, and comprehensive functional annotations. The platform also provides tools for gene search, ortholog mapping, sequence analysis, and structure visualization, supporting studies across diverse biological fields. The cover depicts a schematic Drosophila whose wings trace evolutionary relationships across species, while its body and projected interface symbolize DrosGB shedding light on multi-omics data, comparative genomics, and functional discovery.

All Papers

1. Exploring innate immunity through the lens of fruit fly models

hLife | 对话诺奖得主Jules A. Hoffmann教授：从黑腹果蝇模型看天然免疫探索历程

通信作者：Dominique Ferrandon、Jules A. Hoffmann

本文由诺贝尔奖得主Jules A. Hoffmann教授领衔，法国国家科学研究中心分子与细胞生物学研究所Dominique Ferrandon教授、Jean-Luc Imler教授、中法霍夫曼免疫研究所所长焦仁杰教授、蔡华研究员、陈笛研究员和魏传贤研究员等来自中、法两国的老、中、青三代科学家齐聚一堂，共同回顾了天然免疫研究领域的里程碑事件，当前的研究趋势、新的研究工具以及这一快速发展领域未来的挑战和机遇。此外，还强调了黑腹果蝇作为天然免疫相关研究的动物模型所具备的优势，黑腹果蝇模型对天然免疫各相关领域（包括抗真菌、细菌、病毒及肿瘤等）的发展做出的历史性贡献，以及该模型连接基础研究与医学应用之间的桥梁作用。

引用：

Chen D, Cai H, Wei C, et al. Exploring innate immunity through the lens of fruit fly models. hLife 2026; 4: 257–266.

2. Porphyromonas gingivalis links Alzheimer’s disease and periodontal disease: Neuroinflammatory mechanisms and therapeutic implications

hLife | 安医大张亨国团队综述牙龈卟啉单胞菌介导口腔–脑轴促进阿尔茨海默病进展及治疗的潜在机制

通信作者：孙皖苏、王海涛、张亨国

阿尔茨海默病是最常见的神经退行性疾病，其核心病理特征包括淀粉样蛋白β沉积、Tau蛋白异常磷酸化以及持续性神经炎症。近年来，除经典“脑内病理异常”机制外，外周慢性炎症在AD发生发展中的作用受到越来越多关注。本文围绕牙周炎关键致病菌牙龈卟啉单胞菌及其介导的“口腔–脑轴”进行了系统综述，重点总结了Pg如何侵入患者大脑，诱导神经炎症，进而参与AD进展的潜在机制，为AD的治疗提供了新视角。

Jin S, Wu X, Zhang Y, et al. Porphyromonas gingivalis links Alzheimer’s disease and periodontal disease: Neuroinflammatory mechanisms and therapeutic implications. hLife 2026; 4: 267–288.

3. Hotspots of resistance: How Bangladesh’s environment fuels the antimicrobial resistance crisis

hLife | 被忽视的危机：孟加拉国环境中的抗生素耐药“隐形炸弹”

通信作者：Md. Shakil Ahmed

抗生素耐药性是21世纪最紧迫的全球健康威胁之一。在孟加拉国，这场危机尤为突出。与人们通常的理解不同，这里的耐药问题不仅源于医疗系统中的抗生素滥用，更深植于环境之中。污染的河流、拥挤的贫民窟、集约化养殖业，乃至气候变化，都在共同推动耐药菌的进化与传播。本文系统阐述了环境因素在孟加拉国抗生素耐药危机中的核心驱动作用，并提出呼吁，必须将抗生素耐药性视为一种“生态失衡”，通过综合环境治理来应对这一挑战。

Ahmed MS, Hasan MM. Hotspots of resistance: How Bangladesh’s environment fuels the antimicrobial resistance crisis. hLife 2026; 4: 289–292.

4. DrosGB: An integrated multi-omics database for comparative genomics and functional annotation of 35 Drosophila species

hLife | DrosGB：35种果蝇多组学数据助力直系同源推断与比较基因组研究

通信作者：蔡祥睿、刘陌

果蝇是遗传学和功能基因组学研究的关键模式生物。随着多个果蝇物种高质量基因组的测序完成，跨物种比较分析与基因功能预测迎来了前所未有的机遇。在这一背景下，精准鉴定直系同源基因对于连接不同物种、揭示基因功能的保守性至关重要。然而，现有数据库大多以模式物种黑腹果蝇为核心，对其他果蝇物种的资源整合不足，这在很大程度上限制了系统性的比较基因组学研究。本文构建了果蝇基因组数据库DrosGB (https://www.drosgb.com）。该资源整合了35种果蝇的基因组数据、876个转录组数据集、约42万个三维蛋白结构，并结合OrthoFinder、TOGA、Foldseek和 SonicParanoid2四种方法构建高可信直系同源基因集，旨在为果蝇属的比较基因组与功能研究提供多组学数据支持。

Zheng Q, Zhang C, Zhang J, et al. DrosGB: An integrated multi-omics database for comparative genomics and functional annotation of 35 Drosophila species. hLife 2026; 4: 293–308.

5. MMP12 exacerbates pulmonary inflammation by enhancing IL-17A expression

首医附属北京朝阳医院李洁琼等研究团队揭示MMP12蛋白介导白细胞介素-17A抵抗肺炎支原体感染的新机制

通信作者：童朝晖、宋楠、李洁琼

肺炎支原体是引起人类支原体肺炎的主要病原体，占非细菌性肺炎的50%左右。尽管该病原体感染通常症状较轻且具有自限性，但仍有约25%的患者因发展为严重肺炎或出现肺外并发症而需要住院治疗。因此，早期干预对减少重症支原体肺炎的发生至关重要。社区获得性呼吸窘迫综合征毒素是一种ADP-核糖基化和空泡化的细胞毒素，是目前发现的肺炎支原体唯一毒力因子。尽管已有CARDS毒素依赖KELED序列调控肺部炎性反应的相关报道，但其具体的分子机制至今仍未完全阐明。本文发现基质金属蛋白酶12通过促进IL-17A表达加重肺部炎症反应，揭示了肺炎支原体CARDS毒素诱发肺部免疫的新机制，这一发现也为肺炎支原体感染相关疾病的临床辅助治疗提供潜在的靶点。

Xu Y, Wang X, Yang N, et al. MMP12 exacerbates pulmonary inflammation by enhancing IL-17A expression. hLife 2026; 4: 309–326.