随着多组学技术与人工智能的深度融合，微生物组研究正经历从“现象关联”向“机制驱动”及“临床转化”的范式迁移。本辑精选了11篇前沿原创研究与综述，旨在系统呈现该领域的变革性进展。诚邀学术同仁共读，深入探讨人体微生物组如何重塑我们对疾病机理、临床诊疗及健康管理的认知。

1. Fecal microbiota transplantation in clinical practice: Present controversies and future prospects

hLife | 肠菌移植疗法的应用困境及破局之法

通信作者：陈启仪、秦环龙

本文结合国际最新临床试验结果和上海十院肠道微生态诊疗中心近万人临床实践数据，开创性提出肠菌移植疗法（FMT）对肠内和肠外疾病的治疗响应规律，系统讨论临床实践中供体、受体和临床因素对患者预后的影响，提出大数据平台解决方案以提高重大慢病患者对FMT疗法的治疗响应。

引用：

Tian H, Wang X, Fang Z, et al. Fecal microbiota transplantation in clinical practice: Present controversies and future prospects. hLife 2024; 2: 269–283. 

2. Crucial functions of gut microbiota on gut–liver repair

hLife | 中国医科大学孙逊团队揭示肠道菌群在肠—肝轴修复中的重要作用

通信作者：郑倩倩、孙逊本文结合肠—肝轴双向通讯系统探讨了关键肠道菌群和微生物代谢产物之间的相互作用及其在维持肠道完整性和促进肝脏再生中的关键功能，并对其调控机制和潜在治疗策略进行了深入分析，强调了精准医学框架内个性化微生物干预的前景，对于加速基础研究到临床应用的过渡以及防治相关肠、肝疾病提供了理论基础。

Wang Y, Yan H, Zheng Q, et al. Crucial functions of gut microbiota on gut–liver repair. hLife 2025; 3: 364–385.

3. Fecal microbiota transplantation: A new strategy to delay aging

hLife | 粪菌移植：延缓衰老之“新策略”

通信作者：任捷、刘光慧

本研究系统总结了粪菌移植在衰老研究中的最新进展：与老年人或患病个体相比，年轻个体的肠道微生物群对宿主有益；当寿命较长物种的肠道微生物群移植到寿命较短的物种中时，也会对宿主产生有益影响。

Yan H, Ren J, Liu GH. Fecal microbiota transplantation: A new strategy to delay aging. hLife 2023; 1: 8–11.

4. Regulatory functions and mechanisms of human microbiota in infectious diseases

hLife | 人体微生物群在感染性疾病中的调控功能与作用机制

通信作者：张令强、刘翠华、柴琪瑶

文章系统综述了微生物群、人类宿主和病原体三维调控网络在感染性疾病中的调控功能和作用机制，以及外界环境因素对此过程的动态影响，并深入探讨了基于人体微生物群开发感染性疾病诊断、预防和治疗新手段的新思路与新策略。

Fang Y, Lei Z, Zhang L, et al. Regulatory functions and mechanisms of human microbiota in infectious diseases. hLife 2024; 2: 496–513.

5. Altitude adaptation: The unseen work of gut microbiota

hLife | 高原适应新视角：肠道菌群的作用及潜力

通信作者：毕玉晶、杨瑞馥

低压低氧等高原环境因素导致低海拔人群暴露时面临巨大的生理挑战，严重时可危及生命。目前尚无有效手段减轻高原环境对机体的生理胁迫。肠道菌群作为人体最大的微生态系统，在促进机体适应极端环境方面具有重要作用，成为改善高原反应的新靶点。本文系统综述了肠道菌群与高原适应方向的研究进展，以期为改善高原反应提供理论支撑。

Guo J, Zhao R, Li K, et al. Altitude adaptation: The unseen work of gut microbiota. hLife 2024; 3: 5–20.

6. Microbiota, chronic inflammation, and health: The promise of inflammatome and inflammatomics for precision medicine and healthcare

hLife |菌群、慢性炎症与健康：炎症组学开启精准医疗新时代

通信作者：杨瑞馥、朱宝利、Seppo J. Salminen

本文系统阐述了肠道微生物群通过调控慢性炎症影响肥胖、代谢疾病等全身性疾病的机制，开创性地提出“炎症组”和“炎症组学”这两个术语，旨在解码菌群失调驱动的慢性炎症，并阐明其与疾病的关联。

Zhang H, Yang Lee BJ, Wang T, et al. Microbiota, chronic inflammation, and health: The promise of inflammatome and inflammatomics for precision medicine and health care. hLife 2025; 3: 307–326.

7. Interactions between microbiota and innate immunity in tumor microenvironment: Novel insights into cancer progression and immunotherapy

hLife | 肿瘤微环境中的微生物与固有免疫互作：肿瘤免疫治疗新视角

通信作者：徐冉、韩新巍

本文总结了健康和肿瘤状态下微生物与宿主固有免疫系统之间错综复杂的相互作用，阐述了肿瘤发生发展过程中的免疫识别和极化调节，介绍了利用微生物进行肿瘤免疫治疗的最新进展和挑战，为基于微生物的创新肿瘤免疫疗法的开发提供了新视角。

Zhou Z, Lv Y, Zuo A, et al. Interactions between microbiota and innate immunity in tumor microenvironment: Novel insights into cancer progression and immunotherapy. hLife 2025; 3: 462–493.

8. Dissection of intratumor microbiome–host interactions at the single-cell level in lung cancer

hLife | 上海交大刘宁宁等团队揭示肺癌瘤内微生物组与宿主在单细胞水平相互作用机制

通信作者：吴文娟、郑小琪、刘宁宁

本研究整合了公开发表的6套共149个肺癌患者组织样本的单细胞RNA测序数据集（包含肺癌、癌旁和脑转移组织三种样本类型），利用SAHMI（宿主单细胞-微生物组互作技术）对单细胞转录组测序序列进行分析来识别与单细胞相关的微生物，通过排除潜在的污染和假阳性的微生物序列，同时去除多数据集整合的批次效应，最终确定了与单个宿主细胞相关的真实微生物序列。通过与对应组织的单细胞转录组联合分析，探究了单细胞分辨率下不同类型宿主细胞与肿瘤内特定细菌和真菌相互作用的潜在机制，为理解瘤内微生物组与肺癌发展的关系提供了新理论，有望发现新的癌症诊断和治疗靶点。

Ma YJ, Sun YC, Wang L, et al. Dissection of intratumor microbiome–host interactions at the single-cell level in lung cancer. hLife 2025; 3: 391–406.

9. Reconciling host-microbiota metabolic incompatibility safeguards male fertility

hLife | 肠道菌群与宿主代谢的兼容性：揭秘对雄性生育力的影响 

通信作者：彭敏

本研究揭示了宿主酶ACSS1和ACSS2在调控肠道菌群产生的乙酸方面的关键作用，进而维持雄性小鼠的生育力。提示了宿主与微生物之间代谢不兼容性的处理机制，以及肠道菌群与宿主代谢及生殖系统之间相互作用和影响的重要性机制。

Shang Q, Li Z, Yin N, et al. Reconciling host-microbiota metabolic incompatibility safeguards male fertility. hLife 2024; 2: 284–295.

10. Skin microbiome dysbiosis in Prototheca wickerhamii infection

hLife | 上海市东方医院吴文娟团队联合南京鼓楼医院沈瀚团队通过微生物组学揭示了无绿藻皮肤感染过程中的菌群变化特征

通信作者：沈瀚、吴文娟

无绿藻是唯一能够导致人类和动物感染的微藻，属于医学藻类。无绿藻的菌落形态与酵母样真菌相似，曾归类为真菌。1913年，研究发现无绿藻和小球藻有相同的繁殖方式，分类学最终将其归为藻类。无绿藻属目前共有18个种，常见的引起人类感染的主要是威克汉姆无绿藻。然而，由于其感染后临床表现无特异性且较为罕见，临床医生对其认识有限，无绿藻感染常常被低估和误诊。本研究将传统的培养方法与微生物组测序技术相结合，全面地解析了受感染皮肤中微生物的多样性。

Zhang Y, Guo J, Zhu R, et al. Skin microbiome dysbiosis in Prototheca wickerhamii infection. hLife 2025; 3: 410–412.

11. Nervonic acid alleviates stroke and its associated poststroke depression behaviors

hLife | 神经酸，一种改善大鼠卒中和卒中后抑郁行为的潜在药物

通信作者：李福利、冀培丰、杨洪军、李贤煜

本研究发现神经酸可以实现脑中原位的补充，实现上调大鼠脑源性神经营养因子和髓鞘碱性蛋白的表达；同时灌胃通过“脑-肠轴”跨器官调控，实现肠道微生物群的调节，辅助改善大脑中谷氨酸和苯丙氨酸的代谢，从而达到改善卒中及卒中后抑郁样行为的作用。

Zhang F, Fan Y, Van Phung N, et al. Nervonic acid alleviates stroke and its associated poststroke depression behaviors. hLife 2024; 2: 592–606.