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Biome-BGC模型:批量处理、Python插值、NetCDF裁剪、生长季参数率定、长时间序列模拟、归因分析

已有 419 次阅读 2026-4-20 10:20 |系统分类:科研笔记

Biome-BGC是利用站点描述数据、气象数据和植被生理生态参数,模拟日尺度碳、水和氮通量的有效模型,其研究的空间尺度可以从点尺度扩展到陆地生态系统。

本内容详述利用中国区域地面气象要素驱动数据集(CMFD)和CN05.1气候数据格点化气象数据驱动Biome-BGC在区域上进行模拟。在模拟过程中,需要综合的使用Linux、Python等一些小工具,完成模式的前处理和后处理的工作。

专题一 Biome-BGC模式介绍

Biome-BGC是一个基于日尺度的陆地生态系统生物地球化学过程模型,用于模拟碳、氮和水在不同植被类型(如森林、草地、农田)中的通量与储量的动态变化。该模型通过光合酶促反应机理计算每日总初级生产力(GPP),扣除生长呼吸和维持呼吸后将剩余碳分配给叶、枝条、干和根等器官,并以凋落物形式进入土壤碳库。同时,模型耦合了完整的水循环过程(包括降雨、冠层截留、蒸腾、土壤蒸发、地表径流及土壤水分变化)和能量平衡过程(净辐射、感热通量、潜热通量),并考虑了凋落物分解、土壤有机碳矿化及水分在土层间的木桶模型输送。其模拟空间尺度可从站点扩展到区域,是研究生态系统对气候变化响应的重要工具。

专题二 运行基础

1.Linux应用

实现批量创建文件、删除文件及文件夹

并行化执行程序

2.CDO工具应用

使用cdo工具对netCDF文件进行合并

筛选时间和变量,裁剪为小区域

3.Python应用

Python的循环语句,逻辑语句

创建Numpy数组,并统计计算

使用Matplotlib制作散点图、等值线图

利用零散数据Pandas创建数,制作时间

利用Xarray读取netCDF文件,写入netCDF文件;实现插值工作

专题三 数据处理

在linux上综合使用cdo和xarray数据制备所需数据

1.静态数据制备

地形数据:GTOPO30S 1km

土地利用数据:GLCC 1km

土壤数据:FAO

GPP数据:MODIS数据

2.驱动数据制备

CN05.1数据处理

CMFD数据处理

3.生态数据

MODIS GPP

专题四 单点模拟

1.前处理

从空间格点数据(netCDF格式)插值到站点

配置Biome-BGC运行文件

制备用于驱动Biome-BGC的气象数据

2.运行BGC模型

3.调参:以MODIS的GPP产品为观测值,使用Python库并行化调整Biome-BGC模型的参数

调整生长季开始和结束

4.后处理

读取Biome-BGC的ascii文件和二进制文件

结果统计计算结果可视化

专题五 区域模拟

区域模拟是将区域上每个格点分别进行计算进行的。在本节案例中,将以一个较小的省份进行高分辨率模拟和在中国进行粗分辨率模拟。

静态地理数据准备

气象驱动数据制备

分配数据

并行运行

合并单点结果为空间数据

专题六 长时间序列模拟案例

使用ERA5作为观测数据的降尺度后的CMIP6未来气候变化降尺度数据

对气象数据降尺度,获得气温、湿度、降水和向下短波辐射

土壤数据、植被数据库查询

准备气象数据和静态数据

后处理模拟结果数据

专题七 分析

在单点和空间模拟数据的基础上,进行以下分析:

敏感性分析:使用敏感性分析方法(SALib库),分析主要模拟参数对GPP的影响

归因分析:使用通径分析方法(semopy库),结合气象要素,分析对GPP和ET的影响过程

推荐:基于LPJ模型的植被NPP模拟、驱动力分析及其气候变化响应预测

随着全球气候变化的日益严峻,理解和预测植被生产力的变化变得尤为重要。深入探讨植被净初级生产力(NPP)的模拟、驱动力分析及其气候变化响应,利用LPJ模型为研究工具,掌握从GPP到NPP、NEP/NEE等关键量的计算与应用。重点介绍如何通过LPJ及LPJ-GUESS模型,结合气候数据,分析不同气候情景下植被生产力的变化及其对生态系统的影响。

本内容详述如何使用Python及相关生态建模工具(如rasterio、gdal)进行地理数据处理和模型预处理,重点掌握栅格与矢量数据的格式转换、空间重采样与偏差修正等技术。通过敏感性分析和情景预测,理解气候变化对不同生态系统的具体影响,进而提升环境预测的精度和可操作性。

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