Network Geometry Inference using Common Neighbors 我们介绍和探索根据两节点共同拥有的邻居的数量来推断复杂网络节点潜在几何坐标的新方法。我们将该方法与HyperMap方法进行了比较,后者只是基于节点之间连接(及无连接),即根据节点间有链接(或没有)。我们发现对于高度数的节点利用共有邻居(common-neighbors) ...
Network rewiring is an important mechanism of gene essentiality change 网络重新布局是基因重要性改变的重要机制 基因重要性 改变对于生物进化十分重要。但是同源物种之间重要性如何变化却是不清楚的。我们根据网络演变的框架和基因组比较分析,研究酵母菌和小鼠 基因重要性 变化的 ...
A mathematical approach to emergent properties of metabolic networks:Partial coupling relations,hyperarcs and fl ux ratios 一种针对代谢网络中的涌现特性的数学方法:局部耦合,超弧和流量参数。 系统生物学中的涌现特性只有在达到一定的复杂程度的时候才能产生。本研究介绍 ...
Loet Leydesdorff和Liwen Vaughan 于2006年发表于 Journal of the American Society for Information Science and Technology (JASIST)上的一篇文章,题目是Co-occurrence Matrices and their Applications in Information Science: Extending ACA to the Web Environment。 我觉得这是很多对共现分析感兴趣的人必须 ...