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译文:一种针对代谢网络中的涌现特性的数学方法:局部耦合,超弧

已有 4300 次阅读 2015-1-28 11:18 |个人分类:生物信息学|系统分类:科研笔记| 不可逆反应, 代谢网, 涌现特性, 超弧

A mathematical approach to emergent properties of metabolic networks:Partial coupling relations,hyperarcs and flux ratios

一种针对代谢网络中的涌现特性的数学方法:局部耦合,超弧和流量参数。

系统生物学中的涌现特性只有在达到一定的复杂程度的时候才能产生。本研究介绍一些在有限代谢网络分析中出现的涌现特性。这些属性一般是网络中超弧和不可逆反应出现后造成的。本文介绍一些代谢网络,这些网络中至少有两个反应的流量不能作为网络的化学计量学的参数或产物。我们发现任何一个网络至少存在一个超弧。此外,我们证明,局部耦合不能在少于4个反应或者少于3个不可逆反应或者没有超弧的稳定网络中出现。

 

l 我们介绍了代谢网络的一些涌现属性。

l 这些属性一般由超弧和不可逆反应造成。

l 基于图的模型不适合对这些网络的分析。

Journal of Theoretical Biology  355(2014)185193




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