博文
- GeneToList – 基因名转换（ID convertion）网络服务器
- 小编写过有关基因名的坑的推文，总结了有关基因名的十大坑，见： 基因名坑你没商量 -- 避免踩坑，请查收！ 。今天为大家推荐一款很不错的基因名转化在线服务器 – GeneToList 随着高通量组学技术的日益流行，处理它们所产生的数据集变得越来越困难，因此需要借助于编程语言或者在线服务器，将一个数据库 ...
- [转载]Metaminer：TCGA新玩法，代谢亚型（metabolic subtypes）分类
- 引言：挖掘 T CGA 数据库的文章在 PubMed中有超过1 0000 篇，可以说基本被我们玩的差不多 了，什么肿瘤亚型，生存预后，免疫浸润，等等，在你找不到新思路的时候，不妨来看看这篇有关T CGA 代谢亚型分类的文章，支持在线查询哦！ The Cancer Genome Atlas (TCGA) 数据库是一个综合 ...
- [转载]微生信在线绘制Pathway分类汇总图！
- KEGG Pathway 分析是文献中几乎必备的一项功能分析。在pathway富集分析中，我们一般关注的是输入基因富集到哪些通路，但是殊不知，这些通路还可以进行分类汇总。 在KEGG官网（ https://www.kegg.jp/kegg/pathway.html ）中，将通路分成了7类： 1. Metabolism （代谢） 2. Genetic Informa ...
- [转载]跟着“Science”做张24h 南丁格尔玫瑰图吧！
- “一切平面图形中，圆是最美的”！ -- 古希腊毕达哥拉斯学派 当你对毕业论文，研究报告中使用最多的柱状图出现审美疲劳时，不放将它“掰弯”，连成一个圆试试看，会给你耳目一新的视觉冲击，并且还不占空间。 例如在这篇题为“ Sleep-wake cycles drive daily dynamics of synaptic phosphorylation ”的 ...
- [转载]做个多面手，科研作图不求人（白话篇）！
- 提出问题： 该用什么软件、工具来作图？ 需要学习语言吗？ 别人做出来的图，高大上，我做出来的图，不忍直视？ 科研作图（这里主要指数据图）是我们发文章必需的一种技能。将复杂的数据用简单的图表呈现给读者是我们一直的追求。然而，做出一张漂亮的图，需要花费很多精力；做出一张 ...
- [转载]科研人的520表白 – 微生信在线绘制甜蜜表白词云
- 520网络情人节来了！ 微生信平台给你不一样的表白体验！让我们用“词云”表白！ 什么是词云？ “词云” 就是用不同的颜色展示一段话中出现频率较高的文字，过滤掉一些停用词，非关键文本等， 在 视觉上的突出 ，形成 “ 关键词渲染 ” ，使得人们“看图识文”， 快速领略这段话的主旨。 &nbs ...
- [转载]【转载】新冠肺炎各国疫情圈图在线绘制
- 这个高大上的疫情图，看着就很绚。 最近发现一个能在线绘制这个图的网站，非常不错，输入数据即可绘制！ 其实就是一个极坐标的柱状图。大家可以试试！ 绘图地址
- [转载]还有中文PubMed网站你知道吗？
- 对于科研工作者来说，无论你是写文章还是申请课题，都要阅读大量的文献。可找文献就好像一座怎么也迈步过去的大山，很多英文文献都不能免费下载，对日渐脱发的单身科研汪可谓是暴击伤害！ 之前小编也介绍过很多找文献的神器（除了Pubmed，你可能还需要这些文献数据库），可以回顾一下。 工欲善其事必先利其器，但要记 ...
- CFEA：游离DNA表观遗传修饰(5mC、5hmC、核小体定位）数据库
- cfDNA是疾病液体活检的一种强大工具，而cfDNA的表观遗传修饰对于疾病检测和分类也是至关重要的。 作者使用公共数据库数据，开发了标准化质控、分析流程，并构建了一个网络服务器，以在基因组规模上查询、可视化5mC、5hmC和核小体定位信息。 使用该数据库，用户能够： 1，浏览来自血浆或血清的cfDNA的表观遗传信息 2， ...
- [转载]PACES：预测mRNA中的N4-乙酰胞嘧啶（ac4C）修饰位点
- N4-乙酰胞嘧啶（ac4C）是一种高度保守的RNA修饰，并且是mRNA中第一个描述的乙酰化事件。已经证明mRNA中的ac4C参与mRNA稳定性调控，加工和翻译，但是仍然不清楚ac4C起作用的确切方式。此外，ac4C以生理学上相关的水平广泛分布于人类转录组中，并且迄今为止，实验仅检测了一小部分修饰序列。本研究中，我们开发了一个人类mR ...
