提出问题：

该用什么软件、工具来作图？

需要学习语言吗？

别人做出来的图，高大上，我做出来的图，不忍直视？

科研作图（这里主要指数据图）是我们发文章必需的一种技能。将复杂的数据用简单的图表呈现给读者是我们一直的追求。然而，做出一张漂亮的图，需要花费很多精力；做出一张惊艳的图，则需要更多精力和灵感。

下面我来列举下日常常用的作图工具吧

1.   Excel

Excel绝对是我们最常用的作图工具，没有之一，它的强大之处在于：几乎不用学，人人都会操作！但是不太适合发表论文使用，当然直接将excel出的图放在文章中的也大有人在，不过一般不是矢量图，也就是放大会模糊。

2. 商用/开源作图软件

次常用的作图工具包括各种GUI版的软件，例如origin，graphpad等。这类软件也很易用，功能也越来越多，文章也一大把。但是一般是收费的。例如graphpad官方的价格如下（还是很贵的）！origin便宜点，~500/年。

注：建议不要用盗版，最近有不少使用盗版软件，没有license被撤稿的！

还有其他一些免费/开源作图软件，例如TBtools，eGPS、生信人工具等。这类软件需要下载到本地安装，优点是易用，能处理较大数据。缺点是更新速度受限，模块较少（太多的话，软件会越来越臃肿）。

3．各种在线平台

还有一类是在线作图，例如基迪奥的omicshare，我们微生信等，现在几乎所有公司都有自己的在线工具、作图平台，这也是公司实力的展示，没有在线平台的话，都不好意思说自己是搞数据分析的。这类平台很方便，即插即用型，打开网页，输入数据，出图，全程不要几秒钟。但也有缺点：不能处理太多数据，参数较少等。

4．编程语言

R、Python等语言都有自己的作图包，例如ggplot2，matplotlib等。使用编程来画图的，都是个中高手！正是由于他们的开发，才有了各种软件工具，在线平台。

5，辅助软件

以上各种软件都不能完完全全满足你的定制需求（当然，编程肯定能满足，但是编程太耗费时间），这时，我们就需要用到辅助软件，例如AI，inkscape，photoshop等。例如改个字体，变个颜色，挪个位置，拼个图啥的，很方便。学习成本也很低，低到10分钟就基本会了那种。这里推荐inkscape，免费开源。

当然了，作为一个多面手，我们的电脑里以上软件，工具都要有。因为，一个软件不能解决所有问题，就像我们出行一样，地铁，私家车，小电驴，哈喽等都会用到！例如你要去人民广场，可以全程开车，但是太堵，没地方停，还不如，哈喽+地铁方便。

了解了作图软件和工具，也就可以回答我前面提出的问题：

1， 该用什么软件来作图呢？

看场景和需求。

我的使用经验是，哪个方便，那个快用哪个！效率至上！

场景一：老板让马上做个图出来，没空仔细研究，直接excel画个草图好了

场景二：要开组会，那么不用太研究，直接在线作图好了

场景三：论文的图。这时就要各种软件工具齐上阵了。先出草图，然后用inkscape调整。

场景四：做好几千张图，那么编程吧。

场景五：基因组相关作图，一般的GUI软件还真不带这个功能，需要各种R、Python包，或者TBtools等。

不需要编程的场景：

a.   要讲组会了，等我编程把这个图搞定

程序两小时，在线工具2分钟。写个程序，2个小时过去，组会都开完了！

b.   这两个图要拼起来，我用程序拼一拼

程序两小时，inkscape 2分钟。剩下来的118分，可以去happy了。因为程序是所想及所得，而非所见即所得！

2， 需要学语言么？

有精力的话就学习下，没精力的话，可以使用在线作图，例如我们微生信平台，满足你各种作图分析需求，线上满足不了，还可以线下联系合作。

学习哪门语言？现在大多都是R和Python。精通一种，其他也会，现在需要的不是“金箍棒”型能力，而是“九齿钉耙”型能力。既有广度，又有深度！

3， 别人做出来的图，高大上，我做出来的图，不忍直视？

做所有的事都需要深入学习，作图亦然。首先要对自己的数据有深入了解，了解数据的意义，然后判断你作图的目的，脑海中呈现作图的雏形，作出草图，最终才是放在文章中的图。各种高大上的图，都是经过创作者的深思熟虑，和抓住昙花一现的灵感，将复杂的数据以形象化的视图呈现给读者。

总结：作为写程序画图的一员，因为把好多模块都放在了微生信网站上，所以一般都是直接用微生信平台作图，然后inkscape稍微调调。因为脚本太多，找起来也不方便，而且电脑好几台，每台的配置（例如R，python版本）不一样，出来的图也稍微有差别的，所以就直接用微生信平台了。

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