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Linux/BSD下join命令使数据以tab为分隔符的方法

已有 6695 次阅读 2015-9-4 14:07 |系统分类:科研笔记

[join命令可以通过-t $'t'来把分隔符设为tab字符]

默认情况下,Linux/BSD下的join命令以空格为分隔符。即使你的输入文件是以tab为分隔符的,输出文件也会变成以一个空格为分隔的文件。假如你的数据中存在有空格的字符串,输出结果就会变得混乱,比如:

file1.txt

a        hello

b        join me

file2.txt

a        a b c

b        file

这样的两个文件用命令“join file1.txt join file2.txt”合并后会变成

a hello a b c

b join me file

这样就会难以确定第二列的内容,造成混乱。

考虑到这一点,需要用join的一个参数来确定分隔符,即-t,但是从直觉上的几种使用方法都是不对的,比如

join -t "t" file1.txt file2.txt

join -t"t" file1.txt file2.txt

join -t 't' file1.txt file2.txt

join -t't' file1.txt file2.txt

这样使用会报错,“join: multi-character tab '\t'”(Linux), 或“join: illegal tab character specification” (BSD)。

事实上,这里是因为bash不会把"t"解读为tab键,而把它看成是两个字符——反斜线和t。我同时测试了cut命令,反应与join命令是一样的。

当然,这个问题不会无解,只是我们没有使用正确的用法,正确的用法是用$''来包括t,也就是

join -t $'t' file1.txt file2.txt

双引号是不行的。这说明bash需要的特定的方法来解读反义字符。

这里有一点疑问,就是为什么join 和 cut 之类的命令只支持单字符的分隔符,而且为什么不做一个快捷方式,能够直接解读"t"为tab符号。我想这可能是由于历史原因,或着速度的考量吧,不得而知。

参考资料:

http://stackoverflow.com/questions/8849681/bash-join-command




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1 杨鹏程

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