简单归纳如下：
１、安全性没有充分论证
２、对环境的潜在影响不可忽视
　　比如种过转基因的水稻的田其他植物都无法生长。（这里一个合理的推论是转基因水稻不怕除草剂，于是会被大量使用，因此从此该地里非转基因水稻则无法生长。所谓一旦拥有，必须永久。）
３、农业的控制权完全被外国资本人掌握。
    比如等大面积种植的转基因水稻出现了二次病虫害，你也只好去购买第二代的转基因种子或特定的专利农药来解决，即使最后发现这一切都是在别人原定的算计之中的。因为本地原有的土壤已经被高效全谱系杀虫剂污染，本地原有的物种没有办法恢复种植的。

另外一些无法预计的可以理解的人为因素：
转基因大豆油里面虽然不含蛋白质，被认为是安全的。但数以万吨记的大豆渣到哪里去了。显然进入了饲料甚至其他食品加工行业。最终会流入人们的餐桌。
转基因有毒棉花虽然不会被食用，但大量的棉籽油、棉籽饼呢？很不幸，利益的驱动使之悄然混迹各种食品中。长远危害无法控制。

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