【转载】Genbank格式-from yzwpf

韩天旭 2007-10-7 13:43

Genbank格式：简单地讲，Genbank格式包括三个部分：①描述部分；②特征部分；③序列本身。其中特征部分是记录的最重要部分，它概述了被测序DNA生物的背景。需要注意的是，Genbank格式在最后的末尾必须以//结尾，以示终结。

个人分类: 生命科学—系统发育和进化|5399 次阅读|没有评论

【转载】PHYLIP-from yzwpf

韩天旭 2007-10-7 13:43

PHYLIP是多个软件的压缩包，下载后双击则自动解压。当你解压后就挥发现PHYLIP的功能极其强大，主要包括五个方面的功能软件：i，DNA和蛋白质序列数据的分析软件。ii，序列数据转变成距离数据后，对距离数据分析的软件。 iii，对基因频率和连续的元素分析的软件。iv，把序列的每个碱基/氨基酸独立看待（碱基/氨基酸只有0和1 ...

个人分类: 生命科学—系统发育和进化|3432 次阅读|没有评论

【转载】Mega格式-from yzwpf

韩天旭 2007-10-7 13:42

Mega格式：第一行必须以#MEGA作为Mega格式序列的开头。第二行以Title开头，后面跟上题目，题目必须简洁明了以便于以后的工作。再后面接数据文件的属性描述部分。注释可以标注在任意位置，但必须用方括号[]括起来。

个人分类: 生命科学—系统发育和进化|5670 次阅读|没有评论

【转载】Fasta格式-from yzwpf

韩天旭 2007-10-7 13:41

Fasta格式： Fasta格式，又叫Person（Fasta的主要作者）格式，是最简单的格式，使用最多。 A sequence in FASTA format begins with a single-line description, followed by lines of sequence data. The description line is distinguished from the sequence data by a greater-than () symbol in the first ...

个人分类: 生命科学—系统发育和进化|6055 次阅读|没有评论

【转载】Paup的功能-from yzwpf

韩天旭 2007-10-7 13:41

Paup的功能： PAUP（简约法和其他方法的亲缘分析）是由简约法、最大似然法和距离法用于亲缘分析的程序，为系统发育分析提供一个简单的，带有菜单界面的，与平台无关的，拥有多种功能（包括进化树图）的程序。 ▲ 管理数据（排除元素、删除分类） ▲ 定义假设（增加元素权重、设置元素类型、保存当前假设、重新打开假设） ...

个人分类: 生命科学—系统发育和进化|4264 次阅读|没有评论

【转载】Mega的功能-from yzwpf

韩天旭 2007-10-7 13:40

１Mega的功能： ▲数据输入▲排序功能 数据处理▲密码子分析▲序列综合编辑▲序列阅读▲Substitution Pattern Homogeneity Test 单因子模式替换分析▲遗传距离▲选择测试▲分子钟▲进化树构建▲距离矩阵▲系统树分析 ２Bioedit的功能： 序列处理和编辑功能 ▲ 用于序列处理和编辑的简单的图形界面 ▲ 使用编辑选项包括残 ...

个人分类: 生命科学—系统发育和进化|4277 次阅读|没有评论

【转载】分子进化树构建及数据分析的简介+oldfish的批评意见

韩天旭 2007-10-7 13:38

分子进化树构建及数据分析的简介 mediocrebeing, rodger, lylover , klaus, oldfish, yzwpf 一、引言 开始动笔写这篇短文之前，我问自己，为什么要写这样的文章？写这样的文章有实际的意义吗？我希望能够解决什么样的问题？带着这样的 ...

个人分类: 生命科学—系统发育和进化|8724 次阅读|没有评论

【转载】分子进化树构建及数据分析的简介

韩天旭 2007-10-7 13:16

分子进化树构建及数据分析的简介 mediocrebeing, rodger, lylover , klaus, oldfish, yzwpf lylover. Email: lylover_2005@tom.com 一、引言 开始动笔写这篇短文之前，我问自己，为什么要写这样的文章？写这样的文章有 ...

个人分类: 生命科学—系统发育和进化|6817 次阅读|没有评论

本页有 1 篇博文因作者的隐私设置或未通过审核而隐藏