Google云计算与系统生物学

Google今年推出了海量云计算服务。作为衡量云计算效率的一个标杆性工作，是所里Ilya小组为全美癌症全基因组工程(TCGA)做的全基因组癌症关联计算。The Cancer Genome Atlas (TCGA) 工程始于2009年，两年内投资2.75亿美元，五年内计划对主要的二十种癌症有关基因变化的林林种种全部搞清楚 （最近在Hutchinson癌症中心听的一个报告，未来一到两年这些都会被实现）。Eric Lander 在Youtube上有一个很精彩的综述，我就不用罗嗦了。

Eric Lander 在Youtube上Cancer Genome Atlas (TCGA) 工程的综述

http://www.youtube.com/watch?v=gGdcgUub6YQ

TCGA未来五年的路线图

Ilya小组有一个1000个CPU的计算机集群，但对这样一个浩大的工程也显得势单力薄。比如，计算一对基因的在某种癌症中的关联性需要大概十分钟（人类大概有25000个基因，想想看这得多长时间）。 今年他们和Google合作，使用了云计算中大概60万个CPU，计算速度大为提高。在Google云计算的主题演讲(Google IO Keynote speech)中被作为一个标杆性工作。当屏幕上蓝色连接在‘塔塔’声响中飞速出现时，台下掌声四起，欢呼一片。

http://www.youtube.com/watch?v=3igX-ebL-PY

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