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本地blast结果一键提取比对序列信息 2

已有 2947 次阅读 2021-11-27 01:04 |个人分类:生物信息|系统分类:科研笔记

      利用本地BLAST一文编写的小程序BLAST后,结果里会出现两个文件:*_out_detail.txt文件和*_out_simple.txt文件。在“本地blast结果一键提取比对序列信息”一文中,介绍的自编的小程序unigene_from_blast_out_detailV1.0.exe可以在比对结果*_out_detail.txt中快速提取Identities = 100%的序列信息(序列号和序列),本小程序unigene_from_blast_out_simpleV1.2.exe 可以从  *_out_simple.txt中提取所有序列号,并去除重复的序列号,得到唯一的序列号,并生成xlsx文档,这样利用前面“办公小程序:Excel文件提取关键字所在行 ”介绍的excel内容分类.exe小程序,转录组注释的xlsx文档中提取出序列相关注释、或转录组表达量FPKM所在的xlsx文档中提取出序列的表达量数据。文件储存于unigene_from_blast_out_detailV1.0.exe所在百度网盘相同文件夹中:

    小程序存贮在百度网盘: 

            链接:https://pan.baidu.com/s/1SYneWTkLnSrYxvPaqxaTiA 

            提取码:a016


使用说明: 1. 将此exe文件和*_out_simple.txt放在任一文件夹中,双击后根据提示操作即可。

              

                

注意事项:

                1. 本程序仅适用于win10操作系统。

 致谢:

        1. python 社区(https://www.python.org/)。

        2. pandas、numpy、colorama和openpyxl软件包的开发者、维护团队及资助者。







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