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本地blast结果一键提取比对序列信息

已有 3724 次阅读 2021-11-22 19:35 |个人分类:生物信息|系统分类:科研笔记

     利用本地BLAST一文编写的小程序BLAST后,结果里会出现*_out_detail.txt文件。如果手工从这个文件中提取比对Identities = 100%的序列信息会比较繁琐,尤其是比对出的序列较多时。为此,编写了个小程序,用于一键提取相关信息到xlsx文件中。

    小程序存贮在百度网盘: 

            链接:https://pan.baidu.com/s/1SYneWTkLnSrYxvPaqxaTiA 

            提取码:a016


使用说明: 1. 将此exe文件和*_out_detail.txt放在任一文件夹中,双击后根据提示操作即可。

              

                

注意事项:

                1. 本程序仅适用于win10操作系统。

 致谢:

        1. python 社区(https://www.python.org/)。

        2. pandas和numpy软件包的开发者、维护团队及资助者。






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