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2019 PLOS ONE 利用土壤细菌物种平衡指数估算马铃薯作物生产力

已有 383 次阅读 2024-3-4 16:45 |个人分类:生物信息学|系统分类:科研笔记

原文链接:Using a soil bacterial species balance index to estimate potato crop productivity | PLOS ONE

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摘要

“分子-组学”工具和计算分析平台的发展大大提高了我们评估农业实践和作物管理规程对土壤微生物多样性影响的能力。然而,农业管理模式中很少考虑生物因素。如今,我们已经可以识别特定的微生物群,并确定有助于提高土壤质量的生物成分。我们对 51 个马铃薯生产地块的土壤细菌多样性进行了评估。我们描述了一种基于扩增子序列变异确定马铃薯作物产量细菌物种平衡指数的策略。我们观察到土壤质地平衡对马铃薯产量有重大影响;但是,香农和 Chao1 丰富度指数以及 Pielou 均匀度指数与这些产量的相关性很低。尽管如此,我们还是能够利用细菌微生物组中与马铃薯剩余产量呈正相关或负相关性的元素得出的综合物种平衡指数,估算出细菌微生物组总量中与马铃薯产量相关的部分。这种基于微生物组选择程序的创新策略大大提高了我们解释农业实践和种植系统管理选择对微生物多样性和马铃薯产量影响的能力。这一策略为种植者和更广泛的农业部门在有关土壤质量和作物产量的决策过程中提供了额外的工具。

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