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RDA| glmm| beta多样性| rdacca.hp| 常规统计| 基金| 刊物| 转载| 水杉统计讲坛|

关于排序图标识的虚化代码: 赖江山 2018-10-13 21:55; #有时候排序图的中物种或样方过多，造成标识重叠的情况，可以用vegan包中的orditorp将标识虚化 ## A cluttered ordination plot : library(vegan) data(BCI) mod - cca(BCI) plot(mod, dis=sp, type=t) # Now with orditorp and abbreviated species names cnam - make.cepnames(names( ...; 个人分类: RDA|3597 次阅读|没有评论

ggplot2柱形图更改坐标顺序: 赖江山 2018-9-22 22:48; #例子如下： library(ggplot2) v1-c('w','h','a') v2-c(4,56,23) df-data.frame(v1,v2) ggplot(df,aes(x=v1,y=v2))+geom_bar(stat='identity') #得出结果如下图： #想让横坐标柱子排序按照v1赋值时出现（即w、h、a出现），但是ggplot2默认按字母排序了 ...; 个人分类: RDA|23420 次阅读|没有评论

打开Rstudio时候出错的问题解决: 热度 1 赖江山 2018-9-18 16:06; 很多的人安装R和Rstudio后，打开Rstudio过程，出现说C:\user\???出现无法链接的情况，一般是这个临时文件的路径中有中文Rstudio不认识，需要修改这个临时的文件的路径，具体见下面的修改临时文件的中文路径的介绍 https://zhidao.baidu.com/question/748080860947976012.html; 个人分类: RDA|5899 次阅读|1 个评论热度 1

在R里面将有经纬度的取样点在google地图标出: 赖江山 2018-9-2 22:56; 将有经纬度的取样点在google地图标出数量生态学-R语言应用第二版第二章有代码将带经纬度取样的主动投射到google地图大家可能会经常用到，特意提前先贴这里，使用下面代码前提你的电脑必须能上google Doubs鱼类数据取样点经纬度信息在Doubs.RData的文件里面，下载后直接运行下面代码即可 Doubs.RData # ...; 个人分类: RDA|13533 次阅读|没有评论

计算两个矩阵中不同变量相关系数和p值的函数: 赖江山 2018-8-13 10:37; # 刚有人问，有两个矩阵，一个物种矩阵，一个是环境因子矩阵，要算所有物种和所有环境因子之间的俩俩 #相关系数和p值，找不到现成的函数做，写循环又比较繁琐。我简单写了函数解决这个问题，供大家参考！ #以vegan包中vare物种数据和环境因子数据为例 library(vegan) data(varespec) data(varechem) r=cor(varespec, ...; 个人分类: RDA|8505 次阅读|没有评论

推荐书目《基于R语言林学数据分析》英文版: 赖江山 2018-3-9 16:50; 最近偶然看到Springer 出版R系列丛书有一本Forest Analytics with R，林学方面的学者可以关注一下，CRAN还有与这本书匹配的程序包FAwR。这本书具体的中文目录如下： 1. 引言 Introduction 2. 森林数据管理 Forest Data Management 3. ...; 个人分类: RDA|5582 次阅读|没有评论

《数量生态学-R语言的应用》英文版第二版即将3月份出版: 赖江山 2018-3-5 14:50; NEwR-2ed_code_data.zip 由著名数量生态学家，数量生态学学科创始人Pierre Legendre教授实验室编写的《Numerical Ecology with R》英文版第二版即将由Springer在2018年3月底发行。 https://www.springer.com/us/book/9783319714035#aboutBook 第二版在第一版的基础上，加入多重对应分析（multiple correspondenc ...; 个人分类: RDA|7756 次阅读|没有评论

自动更新R的版本: 热度 1 赖江山 2017-10-19 22:05; 利用R语言命令自动更新R语言软件的版本 install.packages( installr ) library (installr) updateR () 下载完后会提示安装，安装目录，安装成功后，提示是否将old library复制到new library中但是这个方法下载后，不能删除掉旧版本，还得手动删除旧版本。 ...; 8416 次阅读|2 个评论热度 1

如果CRAN上找不到包，那怎么办？: 热度 1 赖江山 2017-5-3 13:37; #如果CRAN包找不到的包，可以使用githubinstall函数来找包的资源 install.packages('githubinstall') #已发布至CRAN library(githubinstall) githubinstall('AnomalyDetection')#输入任何包的名称即可在web上找到这些包的位置; 个人分类: RDA|7379 次阅读|1 个评论热度 1

已知经纬度直接算地理距离的函数: 热度 1 赖江山 2017-4-11 08:20; install.packages(geosphere) library(geosphere) xy - rbind(c(0,0),c(90,90),c(10,10),c(-120,-45)) distm(xy) xy2 - rbind(c(0,0),c(10,-10)) distm(xy, xy2); 个人分类: RDA|5632 次阅读|1 个评论热度 1

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