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置顶 · 升级版|16srRNA微生物多样性测序报告解读
2021-4-1 17:29
微生物多样性测序(扩增子测序)是基于二代高通量测序对16S/18S/ITS等序列进行测序。可以同时检测样本中的优势物种、稀有物种及一些未知物种的检测,获得样本的微生物群落组成以及相对丰度。 相信关注我们的小伙伴对此并不陌生。 这次我们整合了大家平时会遇到的一些问题,在原有的基础上对报告进一步完善。 ...
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置顶 · [转载]多快好省的宏基因组研究技巧 — 资深专家分享
2020-4-27 13:34
谷禾健康 原创 近年的研究热点集中于环境和生物体相互作用的微生物群体,而大量复杂的微生物群体存在培养困难,构成复杂(包括细菌、古菌、真菌、原生生物、病毒甚至小型真核生物)。因此 如何用高通量精准的了解这些群体的构成,基因功能分布以及具体的表达活性和代谢状况 成为首要问题。 高通量测序技术 ...
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置顶 · [转载]微生物多样性测序结果如何看?
隐藏 2019-11-18 14:37
原文 如何读懂和利用你的微生物多样性测序结果? 谷禾健康 原创 做过16s测序的小伙伴们都知道 测完之后会拿到一份结果报告 但这并不代表可以开始写文章了 看似一大堆数据图表却不知如何下手 这是很多人头疼的地方 那么怎样给报告中的数据赋予灵魂 让它真正成为对你有帮助的分析呢? 今天我们来详细解 ...
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[转载]从粪便菌群移植到下一代有益菌:Anaerobutyricum soehngenii为例
牛耀芳 2023-1-10 11:29
我们知道,肠道微生物群对人类健康和福祉很重要,调节宿主代谢,塑造免疫系统并防止病原体定植。 通过 粪便微生物群移植 (FMT)恢复平衡多样的微生物群,已成为研究疾病发病机制中微生物群因果关系的潜在治疗策略和 有前途的工具 。 然而,FMT 带来 了后勤方面的 挑战 和潜在的 安全风险 ,如病原微生物的转移、 ...
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[转载]肠道核心菌——戴阿利斯特杆菌属 (Dialister)
牛耀芳 2023-1-4 14:36
戴阿利斯特杆菌属 ( Dialister ) ✦ Dialister ( 戴阿利斯特杆菌属 )是小的、厌氧或微需氧的 革兰氏阴 性球状或杆状菌,因次也被翻译成 小杆菌属 。 Dialister 菌是人体肠道菌群中的一种常见菌种。该菌属物种被发现出现在人体 全身各个部位 ,包括骨骼和血液,但是主要从人体 粪便,口腔 以及 上 ...
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[转载]客观认识植物乳杆菌 (L. plantarum) 及其健康益处
牛耀芳 2023-1-3 11:03
人体消化系统包含大约 几百到几千种 不同的细菌种类,其 丰度构成因人 而异。 其中 少数益生菌乳杆菌属 ,即嗜酸乳杆菌、 植物乳杆菌 、短乳杆菌、乳酸乳杆菌、干酪乳杆菌、保加利亚乳杆菌、发酵乳杆菌、鼠李糖乳杆菌特异性产生细胞外蛋白、胞外多糖、细菌素和脂磷壁酸,通过与上皮细胞相互作用影响宿主的健康和生 ...
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[转载]阴道菌群——贯穿女性一生
牛耀芳 2023-1-3 10:18
​ 阴道微生物组是一个 复杂 而 动态 的微生态系统,在女性月经周期和女性的 一生中 不断发生波动。 在过去几年中,对阴道微生物群关注随着测序技术的发展和应用逐渐广泛和突出,有关以往传统正常和异常阴道微生物组的知识也发生了变化。培养技术可能 不再适用于 确定正常或异常的阴道微生物群。以非培养为基础 ...
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[转载]体育锻炼与饮食相结合:调节肠道菌群来预防治疗代谢性疾病
牛耀芳 2023-1-3 09:46
久坐不动 的生活方式已逐渐成为现代社会很多人的一种常态,因此导致2型糖尿病 、肥胖、心血管疾病和非酒精性脂肪肝等 代谢性疾病 的 发病率上升 。 ★ 代谢性疾病严重危害人体健康 根据世界卫生组织数据库,2019年, 代谢风险 (即高体重指数 (BMI)、高血糖、高血压和高胆固醇)占全球 总健康损失 的近 2 ...
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[转载]新冠疫情下免疫的重要性以及肠道菌群在其中的作用
牛耀芳 2022-12-16 10:51
今年是 新冠病毒 影响的第三年了,在病毒的影响下,我们的 生活方式 发生了很大的变化。近日,多地政府颁布了疫情防控的新政策,除了一些特殊场所,出入其他场所不用扫场所码了。 从一方面说,这样的情况 方便 了我们日常的生活,但是从另一方面来讲,对于 病毒的防范 没有那么严格了。最终如果全面放开的话,我们 ...
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[转载]卵巢早衰与微生物群,营养治疗新进展
牛耀芳 2022-12-15 16:23
​ ​ 卵巢早衰 卵巢早衰(premature ovarian insufficiency,简称POI)在 生殖系统疾病 中位 居首位 ,这些疾病可能会 损害多个功能系统 ,降低生活质量,最终 剥夺女性 患者的 生育能力 。 目前的 激素替代疗法不能改善受孕 或降低全身并发症的发生率,可 部分缓解症状。 日常食物中的营养 ...
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[转载]一文了解渐冻症发病机理及相关干预措施
牛耀芳 2022-12-6 14:09
最杰出的物理学家之一的斯蒂芬·威廉· 霍金 想必大家都知道,以及曾经风靡全网的“冰桶挑战”,它们都与一种 罕见疾病 有关,那就是 渐冻症 。 媒体的宣传让 渐冻症 成为了较为“知名”罕见病之一;2000年丹麦举行的国际病友大会上正式确定6月21日为“世界渐冻人日”。但我们多数人对这种疾病的 认知还不足 。 什 ...
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[转载]肠道微生物群、营养与长期疾病风险:母婴视角
牛耀芳 2022-12-6 12:47
怀孕的母亲 与 体内的胎儿 是息息相关的。由于婴儿接触母体微生物群,母亲和孩子之间的 微生物联系 在怀孕期间形成。而宿主与微生物群的联系在出生后成熟,并进化成为个体生命中 最重要 的 共生关系 之一,对响应营养和环境刺激的 稳态调节 至关重要。 最近,有报道称微生物群在 子宫 内发育,并在整个妊娠期间 ...
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[转载]TaxiBGC ——分类学指导下的生物合成基因簇鉴定流程
牛耀芳 2022-12-5 21:46
当前合成基因簇预测限制较大 微生物基因组中的 生物 合成基因簇 (BGC) 编码具有生物活性的次级代谢物 (SM),它可以在 微生物-微生物 和 宿主-微生物 相互作用中发挥重要作用。 鉴于次级代谢物的 生物学意义 和当前对微生物组代谢功能的深刻兴趣,从高通量宏基因组数据中无偏见地 鉴定 生物合成基因簇可以 ...
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GMT+8, 2024-5-18 12:13

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