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基因编辑系统在阐明植物基因功能和促进分子设计育种方面具有广泛的潜力。然而,单引导RNA(sgRNAs)的效率各不相同,通过生物信息学准确预测其效率仍然存在挑战,特别是在棉花(陆地棉)等作物中。
针对上述问题,中国农业科学院棉花研究所李付广/葛晓阳研究员团队,开发了一种快速、有效的方法,利用一个瞬时表达系统来验证棉花中sgRNAs的功能,它可以在三天内完成。这一策略显著缩短了稳定转化所需的时间,使研究人员能够在短时间内筛选出高效sgRNAs,为棉花基因功能研究和精准育种提供了强有力的工具。

完成的题为“A transient transformation method for pre-screening gRNAs in CRISPR/Cas gene editing”的研究在Journal of Integrative Agriculture(《农业科学学报》(英文),JIA) 2025年11期正式发表。该研究通过评估多个基因的不同gRNA序列的效率,证实该方法可以快速评估gRNA对基因组的编辑效率,从而通过预筛选提高基因编辑的工作效率。

中棉所葛晓阳研究员和詹晶晶博士为通讯作者,中棉所和河南师范大学联合培养博士研究生徐婧辉为论文第一作者。该研究得到新疆兵团农业关键核心技术攻关项目、中国农业科学院创新工程项目、河南省青年杰出人才基金等支持。
论文信息:Jinghui Xu, Xiaocui Yan, Yan Yu, Hang Zhao, Menghan Liu, Ye Wang, Peng Wang, Hongying Duan, Xiaoyang Ge, Jingjing Zhan. 2025. A transient transformation method for pre-screening gRNAs in CRISPR/Cas gene editing. Journal of Integrative Agriculture, 24(11): 4451-4455.
https://doi.org/10.1016/j.jia.2025.04.007
Journal of Integrative Agriculture (《农业科学学报》(英文), JIA) 由中华人民共和国农业农村部主管,中国农业科学院与中国农学会主办,中国农业科学院农业信息研究所承办。综合性英文学术期刊,月刊。创刊于2002年,现任主编为中国科学院院士陈化兰。JIA主要栏目有作物科学、园艺、植物保护、动物科学、动物医学、农业生态环境、食品科学、农业经济与管理等。刊稿类型有综述、研究论文、简报以及评述等。全部论文在Elsevier-ScienceDirect (SD) 平台OA出版。最新SCI影响因子4.4,位于SCI-JCR农业综合学科Q1区。中国科学院分区农林科学1区。2016年以来先后获得中国科协等部委 “提升计划”“登峰计划”“卓越计划”项目支持。
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