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生命科学,科学?哲学? 精选

已有 11448 次阅读 2012-10-19 22:25 |个人分类:随笔感想|系统分类:科普集锦| 生命科学, 哲学

  《苏菲的世界》里面一个恰当的比喻是:宇宙就像是被魔术师变出来的兔子,而我们就是兔子身上的寄生虫。我们无比渺小,因此我们很难看到魔术师随手一挥动作背后所掩盖的真实,我们把这种真实称为:真理。尽管困难,但是人们也从没有放弃对真理的追求。我们有把对真理的追求称为:科学。生命科学属当今科学里最活跃的一个分支了。今天的两篇文献让我对他产生了一种新的想法。

    首先是发表在nature上的一篇letter:NAADP mobilizes calcium from acidic organelles through two-pore channel.

     本文首先是通过序列比对,发现TPC2与已有序列TPC1和TPC3有同源性,然后对TPC2克隆,对其功能进行试验,通过免疫组化技术,确定了TPC2蛋白表达在HEK293细胞里的lysosome膜上。然后TPC2与NAADP 的体外试验非常特异,作者因此推定NAADP就是TPC2的Ligand,再者钙成像技术结合各种阻断剂的试验也非常理想,在TPC2表达的HEK293上,随着NAADP的出现,包浆内Ca++的升高呈现两个上升趋势,对应着Ca++的两次释放过程,自然就联想到:应该是NAADP与TPC2结合,导致TPC2释放Lysome里面的Ca++,然后释放的Ca++进一步触发ER上的受体,从而使包浆内Ca++浓度急剧升高。加上后面的使用阻断剂的试验与上述推断完全吻合,更为重要的是作者所做的TPC2基因knockout小鼠的胰腺细胞的全细胞电流也出现了巨大的不同。所以最终作者得出了下面的Model图:

结论是:TPC2是表达在endosome Lysome上的双孔Ca++通道蛋白,NAADP是其受体,能与它结合,激活释放少量的Ca++,释放的Ca++再激发ER上的InsP3RRYR使更多的Ca++释放。

    乍一看,试验从分子到整体,从体外到体内,逻辑性强,数据特异,得出这样的结论也合情合理,令人信服。

     可是,就在最近Cell上发表的一篇:TPC Proteins Are Phosphoinositide-Activated Sodium-Selective Ion Channels in Endosomes and Lysosomes。却能把上面的结论甩的粉碎。他说1TPCs Are Not Activated by NAADP   2TPC Currents Are Absent in Pancreatic b Cell Lines that Exhibit NAADP-Induced Lysosomal Ca2+Release    3TPC1 and TPC2 Are Not Required for NAADP- or Glucose-Induced Ca2+ Responses in Pancreatic Islets 4TPC Proteins Are Phosphoinositide-Activated Sodium-Selective Ion Channels

     这篇文章的特点是使用一种更加先进的技术,该技术可以直接记录细胞器上的电流,所以对于揭示定位在细胞器上的TPC2通道会显得更加合理。当然,该文章对于,为什么NAADP能够促使包浆内Ca++的释放,没有给出实验性的解释,只是假说是通过第二信使或者是TPC2介导的Na+流或PH 的改变而间接导致的。

    为什么发表在Nature上的文章,居然会得出这样一个与真实相差甚远的结论呢?仔细分析觉得有两点1)仅仅通过NAADPTPC2的体外结合试验,推定NAADP就是TPC2的受体,有失严谨2)通过包浆内Ca++浓度的变化而不是锚定在细胞器上直接去测TPC2导致的电流,推导TPC2通透Ca++,过于仓促

    技术上的局限性,和事物本质的深邃性,都让生命科学的研究中充满着巨大的偶然性。事物背后隐藏的真相只有一个,然而这种偶然性往往会导致对同一件事物有多种不同甚至相互矛盾的结论,常常众说纷纭,莫衷一是。这就像哲学界的意识形态的研究,有许多种配有充分论据的学派,各各抒己见,从不屈从。因为各种局限性,让我不禁觉得,目前生命科学的研究还不够科学,但我相信随着技术的革新和理论的发展,对生命科学的探索会更加严谨,分歧也会更少,得出的结论也会更加接近真实。



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