1、安装AFEPack软件包，需要提前安好的软件有gcc、g++、doxygen、automake、dx、emac、vim。
2、例子运行时找不到 libAFEPack.so，查看看看路径 /usr/local/lib（AFEPack安装的lib文件路径）  是不是写进了/etc/ld.so.conf文件。如果没有，需要加进 这个路径，并以管理员权限运行一次 /sbin/ldconfig。这个做法的依据是：在/etc/ld.so.conf文件中写入动态函数库所在的目录（是目录，不是文件），这样可执行文件运行时，动态函数库就会先加载到内存中，增加了读取速度。ldconfig是将/etc/ld.so.conf的数据读入缓存中。
3、main(int argc, char*argv[])
这个函数中两个参数的意义，argc记录的是命令行中输入参数的数目，以空格分割，argv是一个拥有argc个元素的字符串数组，每个元素保存一个命令行中输入的参数。
4、linux下的路径非常重要，不要搞错。/home/qixinbo/files/AFEPack，而不是/home/qixinbo/AFEPack
5、编程时函数的输入参数弄准。如 triangle_template_dof(triangle_template_geometry)，当时忘了带参数，自由度的设定要有几何信息作准备。
6、在emacs中使用gdb调试程序：http://emacser.com/emacs-gdb.htm#sec-6.3
以下论述有的引自movingmesh论坛上老师和师兄的话，有的是自己感悟，总结以理解：
7、CoordTransform类决定参考单元到网格单元之间的映射的 方式，一般不必修改，只和单元的形状有关系 。三角形和四边形应该读入不同的模板文件， 如果暂时只用三角形，就不必改了。
8、Template.n.tmp_dof文件存储每个几何体上的自由度分布，如0维点、一维边、二维形上各分布有多少自由度。
9、建立有限元空间需要一个网格和一组参考单元，但一般只形成不多于四个的参考单元，用一个数组存储。
10、StiffMatrix类在库中已内置（这个矩阵可看作一个标准的稀疏矩阵样板，偏微分前面的系数为1，而若不为1，则需要自己构造刚度矩阵），故可根据有限元空间直接生成该类的一个对象，然后设置计算矩阵时使用的数值积分公式的代数精度的阶数，再build计算即可。
11、自己构造刚度矩阵时用的getElementMatrix函数可接收两个参考单元信息，这两个可分布在不同的有限元空间上。计算数值积分时，积分点先给在参考单元上，然后通过坐标变换映射到实际单元上，成为实际单元上的积分点。
12、网格可以使用 Gmsh 产生一个比较稀疏的，然后用 mesh_refine_3d  命令进行均匀加密就能获得三维情况下比较大 的网格了。
13、GMSH软件是一个自动的三维网格生成器。安装最好从源代码（source文件）安装，这样能够将函数库链接好，直接使用binary文件可能会找不到函数库。安装gmsh软件需要：一个C++编译器、cmake、FLTK1.1.7以上以及BLAS和LAPACK库（尤其是里面的liblapack-dev）等。
14、两种求解器：（吴师兄）
AMGSolver solver;  solver.lazyReinit(stiff_matrix);
或AMGSolver solver;  solver.solve(stiff_matrix);
lazy模式中用的投影算子是一个比较简单的形式，所以多代数多重网格的准备过程比较简单，但求解时相对慢一些。而普通的模式，准备过程比较长，但求解相对较快。也就是说，这两种方式只是处理同一个问题的两种不同方式，并不代表它们处理问题的范围不同。
比如你要解一个时间发展方程，总刚度矩阵需要频繁改变时，就推荐用lazy模式；如果总刚度矩阵很长时间不变，就推荐用默认的模式，因为可以在反复求解代数系统中节省时间。
15、段错误一般都是内存访问越界，比如一个指针指向没有分配的内存空间。刚写的时候出现段错误，多数原因是类似数组越界访问的情况。比如你一个数组分配有10个，但a[10]就是个没有分配的空间。这主要是因为对问题的数学理解不清晰。（吴师兄）
16、一个单元上插值点的个数决定是什么插值，如果是三角形单元，只有三个节点就是线性插值，三个节点再加上三个中间点就是二次插值。中间点不看作节点。
一个点上的分量个数，就是这个点的自由度；所有点上的分量个数，就是整个单元的自由度。因为分量个数决定了未知参数的个数。每个点上分量个数与连接方式以及维数有关。如只有拉伸作用，没有旋转和扭转，且二维情况下，每个点的自由度为2。当只选择一个方向如x方向时，每个点的分量个数为1。AFEPack包中的自由度文件设定为每个点上有1个自由度。一般情况下每个点上的自由度个数相同（边界除外）。
自由度个数与节点个数不一样。按AFEPack包中的设定，每个点只有一个自由度来讨论：当线性插值时，两者相同；非线性插值时，自由度个数大于节点个数。自由度个数应该与所有点个数相对应。而组装刚度矩阵时，显然不能按节点个数来组装，应该按所有点来组装，所以按自由度来组装，这样自由度就与基函数一一对应。
17、L2Interpolate和L2Project的实现的原理不同：（吴师兄）
（1） L2Interpolate在计算新网格上的值时，只是简单的把新函数上的插值点值通过旧网格求出。例如P1空间，就是计算新网格的节点在就函数上的值，计算量很小；
（2） L2Project的实现就如同它的名字，是要保证L2内积的投影，也就是说，新投影出来的解u_new满足
         int_Omega  u_new * v dx = int_Omega u_old * v dx，
这里v是空间上的任意测试函数。所以操作过程必须做单元上的L2内积，也就是必须要两套网格上的数值积分，所以计算量会比前者大不少，算不动也是正常的。
新旧网格上有些量是必须要守恒的（比如能量），这时从数学角度就要做守恒型投影了。采用哪种算子实际上很依赖于问题，一般我们做网格自适应时都自己根据问题写投影算子。
23、openmpi安装注意点：
（1）configure过程中，--prefix=/path/指定安装路径，然后make all install。
如果使用动态链接库，还必须给环境变量LD_LIBRARY_PATH指定openmpi的库文件路径，即export LD_LIBRARY_PATH=/path/lib同时在环境变量PATH中指定openmpi的可执行文件路径，两项可在~/.bashrc中完成。
（2）在tarball文件的examples文件夹下make一下可以得到例子，用mpirun -np 2 ./hello_f90可以测试一下，如果有问题，如./hello_f90: error while loading shared libraries: libmpi_f90.so.0: cannot open shared object file: No such file or directory 则要检查一下是否$LD_LIBRARY_PATH是空的，执行export LD_LIBRARY_PATH=/usr/local/openmpi/lib以后就行了。
另外：为了用几个节点或者在一个节点上算题，再对ssh作一下工作。
1) sudo apt-get install openssh
2) cd; ssh-keygen -t rsa， 也可以是 ssh-keygen -t dsa 碰见提示就回车和yes.
3) cp ~/.ssh/id_rsa.pub ~/.ssh/authorized_keys， 完成无密码登录授权