陕西作为我国最北端的茶叶产区之一，受复杂地形条件和长期栽培历史影响，形成了以紫阳群体、西乡大河坝群体等为代表的多个地域性茶树种群，蕴含着丰富而独特的种质资源。然而，这些茶树资源的遗传背景及次生代谢物多样性尚缺乏系统解析。现有茶树核心种质构建多依赖表型性状或单一分子标记，难以全面反映遗传变异与代谢特征的协同信息。通过整合全基因组单核苷酸多态性（SNP）与儿茶素代谢数据，可以构建更加具有代表性的核心种质资源，为陕西茶树种质保护与育种利用提供科学支撑。

近期，西北农林科技大学余有本教授/徐清山副教授课题组完成的题为“Core germplasm construction of tea plant populations based on genome-wide SNP and catechins in Shaanxi Province, China”的研究在Journal of Integrative Agriculture（《农业科学学报（英文）》，JIA）2026年5期发表。

该研究收集了320份陕西茶树种质资源，通过全基因组重测序获得2,118,060个高质量SNP标记，系统评估了群体的遗传多样性，显示出陕西省茶树具有较高的遗传变异度。代谢多样性分析表明茶树样本在儿茶素组成上存在显著差异。系统发育分析将320份材料划分为六个遗传类群，揭示了地理来源对遗传结构形成的重要影响。在此基础上，该研究构建了一个包含106份材料的核心种质集合，有效保留了原始群体在分子、代谢、群体结构及区域分布等方面的主要特征。进一步的全基因组关联分析表明，该核心种质群体能够稳定复现原始群体中检测到的性状-标记关联信号，验证了其在茶树遗传研究与育种中的应用价值。

图1 陕西地方栽培种质资源系统发育及主成分分析

图2 基于儿茶素和系统发育分析的茶树个体聚类和类群分布

图3 核心种质分布分析

该研究为陕西茶树种质资源的科学保存、精准评价与高效利用提供了可行路径，也为茶树分子育种和优异种质挖掘奠定了坚实基础。

西北农林科技大学园艺学院博士生王鑫玉、硕士生陈丹和汉中市农业技术推广培训中心李秀峰为共同第一作者，西北农林科技大学余有本教授和徐清山副教授为共同通讯作者。该研究得到了国家自然科学基金、国家茶产业技术体系、陕西省农业关键核心技术攻关、陕西省自然科学基金等项目资助。

Cite the article:

Xinyu Wang, Xiufeng Li, Dan Chen, Jingwen Gao, Shuangqian Hao, He Zhang, Ziyan Zhao, Mengwei Shen, Huirui Chen, Fuqiang Qi, Keyi Zhang, Haozhe Zhou, Yanjun Xi, Jie Zhou, Youben Yu, Qingshan Xu. 2026. Core germplasm construction of tea plant populations based on genome-wide SNP and catechins in Shaanxi Province, China. Journal of Integrative Agriculture, 25(5): 1927-1938.

https://doi.org/10.1016/j.jia.2025.03.024

Journal of Integrative Agriculture（《农业科学学报（英文）》, JIA）由中华人民共和国农业农村部主管，中国农业科学院与中国农学会主办，中国农业科学院农业信息研究所承办。综合性英文学术期刊，月刊。创刊于2002年，现任主编为中国科学院院士陈化兰。JIA主要栏目有作物科学、园艺、植物保护、动物科学、动物医学、农业生态环境、食品科学、农业经济与管理等。刊稿类型有综述、研究论文、简报以及评述等。全部论文在Elsevier-ScienceDirect (SD) 平台OA出版。最新SCI影响因子4.4，位于SCI-JCR农业综合学科Q1区。中国科学院分区农林科学1区。2016年以来先后获得中国科协等部委 “提升计划”“登峰计划”“卓越计划”项目支持。