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ChatGPT+R语言强强联合,助力生态环境数据统计分析、绘图,使数据分析不再难!

已有 542 次阅读 2024-9-29 12:02 |系统分类:科研笔记

内容涵盖了从生态环境领域数据特点及统计方法介绍、GPT入门到GPT辅助R语言基础;数据准备及ggplot 绘图基础;回归和混合效应模型(包含方差分析、协方差分析);多元统计分析(排序、聚类和分组差异检验);随机森林模型;结构方程模型;非线性关系数据分析; Meta分析及贝叶斯回归与混合效应模型等一系列专题及实战案例。每一专题或案例都精心设计,以确保您不仅能够理解各统计模型的基本原理,还能够在GPT的辅助下,有效地开展实际数据分析,轻松应对科研工作中复杂数据局面,提高数据分析能力和效率。

第一章 生态环境数据统计概述及基础

1.生态环境数据特点及统计方法介绍

①生态环境数据复杂性和多样性

②生态环境数据类型及分布特点

③生态环境数据主要统计分析方法及统计检验(t-检验、F检验、卡方检验)

④如何根据数据类型、特点及结构选择合适的统计方法

2.GPT大语言模型简介及使用入门

①GPT大语言模型简介:定义、架构及发展历程

②GPT大语言模型使用入门

③GPT大语言模型提示词(prompt)

●提示词基本语法及应用

●提高大语言模型回答质量策略

④让GPT成为科研助手:文献综述;实验设计;数据分析

⑤GPT与R语言结合开展数据分析优势

3.GPT&R:R语言入门

①GPT辅助安装与配置R和RStudio

②GPT辅助学习R语言程序包和函数用途和用法

③GPT辅助学习R中变量、数据类型、函数等

④GPT辅助开展R语言数据基本操作

4.GPT&R:生态环境数据准备及绘图基础

①生态环境数据类型及常见数据资源

②GPT辅助生态环境数据整理及清洗

③GPT辅助生态环境数据探索

④GPT辅助ggplot2绘图

●基础绘图类型:散点图、箱线图、频率图、提琴图、峰峦图、相关图等

●高级绘图技巧: 多图组合、排版及生成高质量图(论文发表)

第二章 GPT&R:回归与混合效应模型

1.一般和广义线性回归模型(lm&glm)

①一般线性模型和广义线性模型介绍:基本原理、假设条件及应用情景等

②GPT辅助一般线性模型(lm)R语言实现

●回归模型

●方差分析

●协方差分析

●模型诊断

●模型选择(逐步回归)

③GPT辅助广义线性模型(glm)R语言实现

●广义回归模型、链接函数、分布族、模型比较

●逻辑斯蒂回归(0,1数据)

●泊松回归(计数数据):泊松、负二项分布、零膨胀、零截断

2.线性和广义线性混合效应模型(lmm&glmm)

①混合效应模型简介:嵌套数据、固定效应、随机效应等基本概念

②GPT辅助线性混合效应模型(lmm)

●模型构建:模型类型确定(随机截距/随机截距)、模型比较和诊断

●模型结果解读、描述及作图

③GPT辅助广义线性混合效应模型(glmm)

●根据数据特征选择合适的广义线性混合模型误差分布及程序包

●二项分布(0,1)混合效应模型:数据检查、模型构建、结果展示

●计数数据混合效应模型:泊松、过度离散、零膨胀及零截断

④GPT辅助混合效应模型的模型选择(模型average)

3.相关数据分析:空间、时间及系统发育相关

①回归模型数据自相关问题及简介

②GPT辅助空间自相关数据分析案例:模型构建、模型比较、模型诊断等

③GPT辅助时间自相关数据分析案例:模型构建、模型比较、模型诊断等

④GPT辅助系统发育相关数据分析案例:模型构建、模型比较、模型诊断等

第三章 GPT&R:多元统计分析

1.多元统计中的排序分析

①多元统计分析技术在生态环境数据分析应用简介

②GPT辅助多元统计中的排序分析

●非约束排序(PCA、PCoA、NMDS)分析:模型选择、结果解读及绘图

●约束排序(RDA、db-RDA)分析:数据筛选、变量选择、结果解读及绘图

2.多元统计中的聚类分析及分组差异检验

①GPT辅助多元统计中的聚类分析

●层次聚类(hclust):数据检查、聚类聚类质量评估、结果解读及绘图

●非层次聚类(kmeans):数据检查、聚类聚类质量评估、结果解读及绘图

②GPT辅助多元统计中的分组差异检验

●非参数多元方差分析(PERMANOVA)分析

●非参数多元方差分析(PERMANOVA)与非约束排序(PCoA)结合

3.多元统计中机器学习:随机森林(Random Forest,RF)模型

①随机森林模型简介

②GPT辅助随机森林模型分类案例:模型构建、交叉验证、变量重要性评估等

③GPT辅助随机森林模型回归案例:模型构建、交叉验证、变量重要性评估等

第四章 GPT&R:结构方程模型(SEM)(lavaan)

1.结构方程模型(SEM)基本原理

2.GPT辅助结构方程模型(lavaan)分析

●初始模型构建

●模型调整

●模型评估及结果表达

3.GPT辅助潜变量(latent)分析

4.GPT辅助复合变量(composite)分析

第五章 GPT&R:其他统计模型或方法

1.GPT辅助非线性数据分析

①非线性数据分析简介:广义可加模型 VS 非线性模型

②广义可加模型(GAM)案例:模型构建、模型诊断、结果绘图等

③非线性模型(NLM)案例:模型构建、参数设置等

2.GPT辅助Meta分析(Meta-analysis)

①Meta分析基本原理

②Meta分析效应值选则与计算

③Meta分析效应值(累积/平均):随机效应模型、固定效应模型、森林图等

④Meta分析解释变量引入(分类/连续变量)及结果绘图

⑤Meta分析模型诊断:发表偏爱性、失安全系数等

3.GPT辅助贝叶斯回归与混合模型

①贝叶斯回归和混合效应模型简介

②贝叶斯回归模型案例:模型构建、模型诊断及结果绘图

③贝叶斯混合效应模型案例:模型构建、模型诊断及结果绘图

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