中国科学院青岛生物能源与过程研究所单细胞中心徐健研究员团队与深圳市第三人民医院（南方科技大学第二附属医院）卢洪洲教授团队等合作文章“Rapid and quantitative phage susceptibility test by ramanome”已在mLife 正式上线。研究团队开发了基于拉曼组的噬菌体敏感性快检技术RPST，通过捕获噬菌体感染早期宿主菌的分子组成变化，可在1小时内完成对噬菌体感染的快速判别、效能量化及最低有效感染复数测定，为噬菌体筛选、精准给药及临床治疗提供了高效新工具。

在全球微生物耐药性（antimicrobial resistance, AMR）危机日益加剧背景下，噬菌体疗法（phage therapy）正成为应对多重耐药菌感染的重要策略。然而，其临床推广仍受限于缺乏快速、定量、全面评估细菌宿主对噬菌体敏感性的检测方法。现有“金标准”噬菌斑法需通过双层琼脂培养观察噬菌斑形成，通常耗时11–21小时，且通常仅能提供“敏感/耐药”的定性结果，难以量化噬菌体杀菌效能及确定最低有效剂量。针对这一需求，该研究团队开发了RPST (ramanome-based phage susceptibility test) 技术。RPST不再依赖细菌裂解或生长抑制过程，而是直接检测噬菌体感染早期宿主菌细胞的分子组成变化，从而在1小时内一步式完成感染判别、效能量化及“最低有效感染复数（multiplicity of infection, MOI）”测定等噬菌体定量评估流程。

图一 基于拉曼组的快速噬菌体敏感性检测流程

（图片来源：研究团队）

研究发现，噬菌体感染会诱导宿主细菌发生特征性生化组分重构，体现为核酸、蛋白质和脂类等大分子相对含量变化。通过比较多个噬菌体-细菌体系，该团队从拉曼光谱“指纹区”筛选出四个具有一定保守性的特征区段，可较稳定地反映感染导致的生化重塑过程。基于这些特征区段变化特征，该团队提出了“复合感染指数”（Composite Infection Index, CII），可量化表征噬菌体感染进程，并高效区分感染与未感染群体。在涵盖大肠杆菌、铜绿假单胞菌、肺炎克雷伯菌和沙门氏菌等25对噬菌体-细菌体系的验证中，CII与传统噬菌斑法一致性达96.0%，表现出良好的跨菌种适用性。

相比传统噬菌斑法，RPST具有三方面优势：一是流程快速，全流程约1小时，速度提升约10倍；二是结果定量，可对不同噬菌体的裂解能力进行精准排序；三是信息丰富，可通过不同MOI条件下CII的动态变化，测定维持感染扩增所需的最低有效MOI，为临床噬菌体给药方案提供参考。因此，RPST为噬菌体-细菌互作研究和临床噬菌体治疗提供了新工具，有望推动《国务院令818号》技术监管框架下的相关备案临床研究。

该研究依托中国科学院青岛生物能源与过程所孵化企业——青岛星赛生物科技有限公司——自主研发的拉曼微流单细胞分选仪RAMS完成，深圳市第三人民医院提供了噬菌体资源库和临床菌株。

引用本论文：

Han X, Wan X, Zhou Y, Fu X, Zheng X, Gao B, et al. Rapid and quantitative phage susceptibility test by ramanome. mLife. 2026;1–14. 

原文链接：https://doi.org/10.1002/mlf2.70089

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