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[转载]【好文荐读】深度学习助力:穿透生物组织后的拉曼散斑图像的高质量重建

已有 141 次阅读 2026-6-24 09:09 |系统分类:论文交流|文章来源:转载

导语

在肿瘤手术中,如何精准识别病灶边界是一大挑战。尽管拉曼成像技术具有高分子特异性,但在透过生物组织时,信号常常被散射和吸收严重干扰,形成杂乱无序的“散斑图像”,难以直接判读。近日,上海交通大学叶坚教授、林俐副教授、陈舟助理研究员研究团队在《Journal of Innovative Optical Health Sciences》上发表了一项突破性成果:利用深度学习(U-Net)成功从散射后的拉曼散斑图像中重建出清晰的原始图像,为术中导航提供了全新思路。本文第一作者为上海交通大学博士生谢浩强和原本科生王尔佳。

Haoqiang Xie, Erjia Wang, Zhouzhou Bao, Zhou Chen, Linley Li Lin, and Jian Ye.Deep learning-assisted reconstruction of Raman speckle images transmitted through biological tissues.Journal of Innovative Optical Health SciencesOnline ReadyOpen Access

https://doi.org/10.1142/S1793545826400080

正文

研究背景

光学分子成像在术中导航中极具潜力,但生物组织对光子的强散射与吸收,严重限制了图像的分辨率与可读性。尤其是拉曼成像,尽管其分子特异性高,但在穿过数毫米组织后,图像会退化为无序的“散斑”。

研究方法

研究团队使用自主合成的缝隙增强拉曼探针(Gap-Enhanced Resonance Raman Tags,GERRTs)作为高灵敏度拉曼探针,在纸上绘制多种图案,并通过扫描采集两类图像:

参考图像:无组织遮挡,直接采集

散斑图像:透过4mm猪组织后采集

共获得101对图像,并利用U-Net网络(一种对称编码-解码结构+跳跃连接的深度学习模型)进行重建训练。

图1:研究方案示意图。研究团队首先使用GERRTs拉曼纳米探针溶胶在纸上绘制多种图案,通过光纤探针逐点扫描获得清晰的参考拉曼图像。随后覆盖4 mm猪组织,采集因散射而退化的散斑拉曼图像。最后,利用U-Net深度学习模型从散斑图像中重建出原始图案结构。

主要结果

●U-Net在线状图案和封闭图案的重建中均表现最佳,能恢复清晰边缘和内部空洞。

●在4mm厚度组织下,U-Net重建的相似度SSIM达0.539,PSNR为19.04 dB,RMSE低至0.547,优于MHRN和SwinIR。

●在不同组织厚度(1-10 mm)测试中,U-Net在3-5 mm范围内重建效果最佳,超出该范围性能逐渐下降。

图5:不同模型对线状图案的重建效果对比。从左至右依次为:参考图像、输入散斑图像、MHRN重建结果、SwinIR重建结果、U-Net重建结果。可以看出,U-Net在保持线条连续性和交叉点清晰度方面明显优于另外两种模型,尤其对“T”“S”等复杂线状结构恢复最为完整。

图6:不同模型对封闭图案的重建效果对比。封闭图案(如圆环、三角形、双叶形等)透过组织后内部空洞完全消失。U-Net不仅能恢复外部轮廓,还能清晰重建内部空心结构,而MHRN和SwinIR则存在边界模糊或空洞填充不全的问题。

图8:不同组织厚度下U-Net的重建表现。以“O”形图案为例,随着猪组织厚度从1 mm增加至10 mm,输入散斑图像逐渐失去结构信息。U-Net在3-5 mm厚度范围内重建效果最佳,能恢复清晰的环形结构;当厚度超过6 mm后,重建质量显著下降,至8 mm以上几乎无法识别原始图案。值得注意的是,这里作者采用的是4mm厚度猪肉组织上训练的模型,证明模型在一定厚度范围仍具有泛化性。

主要创新点

首次将深度学习用于拉曼散斑图像重建,解决生物组织散射下的图像恢复问题。

采用U-Net架构,通过跳跃连接保留高分辨率空间信息,显著提升重建质量。

系统研究不同厚度组织下的重建表现,明确模型的适用深度范围(3-5 mm)。

结合高亮度的拉曼探针,增强信号强度,提升成像对比度。

应用前景

术中肿瘤边界识别:帮助外科医生在手术中实时判断病灶范围,提高切除精度。

深层组织光学成像:为拉曼成像在深层组织中的应用提供可行方案。

多模态扩展:该深度学习框架也可推广至荧光成像、光学相干断层扫描等受散射影响的成像技术。

结语

这项研究证明了深度学习+拉曼成像在穿透散射组织方面的巨大潜力。尽管在极厚组织(>6 mm)中仍存在挑战,但该工作为未来术中光学导航、非侵入式诊断和组织功能成像提供了坚实的技术基础。

通讯作者简介

叶坚,上海交通大学特聘教授。研究方面为基于人工智能的等离激元纳米材料的模拟设计、合成制备、光学属性及其生物医学应用;拉曼光谱、表面增强拉曼光谱、缝隙增强拉曼探针及其生物医学应用;“数字胶体增强拉曼光谱”和“表面增强拉曼分子组学”的单细胞、单颗粒、单分子超灵敏检测,结合人工智能实现高灵敏、无标记、快速液体活检的疾病诊断和代谢组学检测。

更多详情见https://bme.sjtu.edu.cn/Web/FacultyDetail/57

林俐,上海交通大学生物医学工程学院长聘教轨副教授,研究方向为深穿透光谱技术(Deep Raman spectroscopy)设计和开发;等离激元金属纳米基底的设计与开发;基于拉曼光谱的肿瘤诊断和选择性小分子检测。

更多详情:https://bme.sjtu.edu.cn/Web/FacultyDetail/917

陈舟,上海交通大学生物医学工程学院助理研究员,研究方向为基于机器学习的拉曼光谱快速精准疾病早筛及诊断,多模态生物信息融合。

更多详情见https://bme.sjtu.edu.cn/Web/FacultyDetail/954



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