根瘤菌接种豆科植物后的有效性与许多因素有关，选择合适的接种方式，可提高根瘤菌接种的有效性。

       对于子叶出土的种子，如大豆、花生、菜豆、豇豆等，建议使用液体根瘤菌菌剂直接喷施到土壤内最好，以使种子萌发过程中接触到更多的根瘤菌菌剂；如果做拌种处理，则吸附于种皮表面的根瘤菌很容易被出土的子叶带到土壤外，造成留存于土壤内的根瘤菌数量锐减，最终影响根瘤菌的接种效率。

       而对于子叶不出土的种子，如鹰嘴豆、苦参等，则拌种或液体喷施于土壤均可，如果是拌种，应保证在种子上的菌液未干之前将种子播种到土壤内。

       农业生产中，大面积种植豆类作物时，最好选择液体接种根瘤菌菌剂喷施于土壤的方式。

       对于需要移栽的豆科植物，如中药材甘草、黄芪等，可采用蘸根的方式，在移栽之前，将根系置于根瘤菌菌剂中浸泡20分钟，然后再移栽。

       如果在移栽之前，先形成结瘤苗，再移栽，也是很好的方法，这种方法适合于木本豆科植物的育苗，如培育紫穗槐、刺槐、相思、黄檀、紫藤、紫荆等植物时，先形成结瘤苗，再移栽最好。