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本期编辑荐读精选了Metabolites 期刊2022年Top 10的文章中的5篇,内容涵盖 COVID-19 急性后后遗症、R中代谢组学数据注释、澳大利亚本土植物酚类代谢产物及其抗氧化活性等,欢迎大家阅读参考。
1.Signatures of Mitochondrial Dysfunction and Impaired Fatty Acid Metabolism in Plasma of Patients with Post-Acute Sequelae of COVID-19 (PASC)
COVID-19急性后后遗症 (PASC) 患者血浆线粒体功能障碍和脂肪酸代谢异常特征
Vamsi P. Guntur et al.
文章亮点:
(1) 本文通过基于质谱的非靶向代谢组学分析急性冠状病毒病患者和 COVID-19 急性后遗症患者 (PASC) 的血浆代谢谱,PASC 血浆中脂肪酸代谢物含量较高,一、二和三羧酸盐含量较低,氨基酸代谢物水平较低。
(2) 本文通过 NJH dataSCOUTTM 从生物信息学团队获得与血液样本相关的去识别人口统计数据和 COVID-19 状态。
(3) 分析表明,COVID-19 急性后遗症患者血浆代谢物表明脂肪酸代谢改变和线粒体依赖性脂质分解代谢功能失调。
原文出自 Metabolites 期刊
Guntur, V.P.; Nemkov, T.; de Boer, E.; Mohning, M.P.; Baraghoshi, D.; Cendali, F.I.; San-Millán, I.; Petrache, I.; D’Alessandro, A. Signatures of Mitochondrial Dysfunction and Impaired Fatty Acid Metabolism in Plasma of Patients with Post-Acute Sequelae of COVID-19 (PASC). Metabolites 2022, 12, 1026.
2.A Modular and Expandable Ecosystem for Metabolomics Data Annotation in R
R 中代谢组学数据注释的模块化和可扩展生态系统
Johannes Rainer et al.
文章亮点:
(1) 本文为液相色谱-质谱 LC-MS 仪器和分析定制了注释工作流程的非标准化数据集。
(2) 本文提出了一个 R 包生态系统,以 MetaboCoreUtils、MetaboAnnotation 和 CompoundDb 包为中心,共同为非靶向代谢组学数据的注释提供了模块化基础设施。
(3) R 包所代表的基础设施是一个丰富的工具箱,可以在 R 中构建定制且可重复的注释工作流程,所有核心功能都可以导出,从而可以在其他软件工具中重复使用。
原文出自 Metabolites 期刊
Rainer, J.; Vicini, A.; Salzer, L.; Stanstrup, J.; Badia, J.M.; Neumann, S.; Stravs, M.A.; Verri Hernandes, V.; Gatto, L.; Gibb, S.; et al. A Modular and Expandable Ecosystem for Metabolomics Data Annotation in R. Metabolites 2022, 12, 173.
3.LC-MS/MS Characterization of Phenolic Metabolites and Their Antioxidant Activities from Australian Native Plants
澳大利亚本土植物酚类代谢产物及其抗氧化活性的 LC-MS/MS 表征
Akhtar Ali, Jeremy J. Cottrell and Frank R. Dunshea
文章亮点:
(1) 本文鉴定和表征了澳大利亚本土檀香坚果、金合欢种子、柠檬草和老芒硝的酚类化合物及其抗氧化活性,初步鉴定出155种酚类代谢物。
(2) 本文通过 DPPH、ABTS、FICA、FRAP、PMA 和 OH-RSA 测定了澳大利亚本土植物的抗氧化能力。
(3) 本文采用 Pearson 相关分析方法对澳洲本土植物酚类物质含量与抗氧化活性进行了相关性分析, 结果表明,TPC 与 DPPH (r = 0.98)、RPA (r = 0.99)、FICA (r = 0.97)、OH-RSA (r = 0.98) 呈极显著相关,TCT 与其他抗氧化活性呈负相关。
原文出自 Metabolites 期刊
Ali, A.; Cottrell, J.J.; Dunshea, F.R. LC-MS/MS Characterization of Phenolic Metabolites and Their Antioxidant Activities from Australian Native Plants. Metabolites 2022, 12, 1016.
4.Age, Sex, Body Mass Index, Diet and Menopause Related Metabolites in a Large Homogeneous Alpine Cohort
年龄、性别、体重指数、饮食和更年期相关代谢物在一个大型同质高山队列
Vinicius Verri Hernandes et al.
文章亮点:
(1) 本文展示了最大的单位点靶向代谢组学数据集之一,其中包括6872名 CHRIS 研究参与者的175种量化代谢物。
(2) 本文再次确认以前大规模代谢组学研究中关于代谢物浓度与年龄、性别、BMI、更年期和基于 FFQ 的食物摄入之间关系的大部分发现。
(3) 此外,本文提供的高质量代谢组学数据集可能是后续研究以及大规模联合研究的宝贵资源。
原文出自 Metabolites 期刊
Verri Hernandes, V.; Dordevic, N.; Hantikainen, E.M.; Sigurdsson, B.B.; Smárason, S.V.; Garcia-Larsen, V.; Gögele, M.; Caprioli, G.; Bozzolan, I.; Pramstaller, P.P.; et al. Age, Sex, Body Mass Index, Diet and Menopause Related Metabolites in a Large Homogeneous Alpine Cohort. Metabolites 2022, 12, 205.
5.Evaluation of Syrosingopine, an MCT Inhibitor, as Potential Modulator of Tumor Metabolism and Extracellular Acidification
MCT 抑制剂 Syrosingopine 作为肿瘤代谢和细胞外酸化的潜在调节剂的评价
Chloe Buyse et al.
文章亮点:
(1) 本文评估了昔洛舍平 (MCT1 和 MCT4 抑制剂) 作为人类乳腺癌 (MDA-MB-231) 和咽鳞状细胞癌 (FaDu) 细胞模型中肿瘤代谢和细胞外酸化调节剂的影响。
(2) 在这两种体外模型中,我们观察到暴露于昔洛舍平会导致细胞外酸化率、细胞内 pH 值、葡萄糖消耗、乳酸分泌和肿瘤细胞增殖降低,同时晚期凋亡/坏死细胞数量增加。
(3) 本文的研究表明,MCT 代表了一个有趣的抗癌治疗靶点,但需要进一步研究更特异性的 MCT 抑制剂来确定其在体内的抑制效果。
原文出自 Metabolites 期刊
Buyse, C.; Joudiou, N.; Warscotte, A.; Richiardone, E.; Mignion, L.; Corbet, C.; Gallez, B. Evaluation of Syrosingopine, an MCT Inhibitor, as Potential Modulator of Tumor Metabolism and Extracellular Acidification. Metabolites 2022, 12, 557.
Metabolites 期刊介绍
主编:Markus R. Meyer, Saarland University, Germany
期刊发表与代谢组学、代谢生物化学、计算和系统生物学、生物技术和医学领域相关的代谢物以及代谢方面的原创研究文章与评论文章。
2022 Impact Factor:4.1
2022 CiteScore:5.3
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Time to Publication:38 Days
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GMT+8, 2024-11-25 00:07
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