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狂犬病毒:结构、组成、感染循环和生命周期(12)
(Rabies virus: Structure, composition, infection cycle and life cycle)
前记:
目前国际上关于狂犬病研究最权威最全面的大型学术专著是《狂犬病:科学基础和管控(RABIES: SCIENTIFIC BASIS OF THE DISEASE AND ITS MANAGEMENT)》,简称《狂犬病(RABIES)》。该书最新版(第4版)已于2020年5月面世。
该书共有22章,其中第2章是《Rabies virus(狂犬病毒)》。
现将此章的内容全文翻译成中文供参考。
第2章 狂犬病毒(12)
Rabies virus
3 基因组与RNP结构(续)
3.1 基因组一级结构
狂犬病毒属病毒的单链负义RNA基因组(vRNAs)是典型的MNV(单股负链病毒)基因组。它们的长度约为12 kb,具有未修饰的3'-羟基(3'-OH)和5'-三磷酸(5'-PPP)末端。基因组由五个基因按严格保守的顺序(3'-N-P-M-G-L-5')排列而成,两侧分别为短的3'端和5'端非编码调控区,分别称为前导(Le)区和尾随(Tr)区(图2.3)。
3'端的前导(Le)区可被视为基因组启动子(genomic promoter,GP),它指导单顺反子mRNA的转录以及全长反基因组RNA(cRNA)的合成。cRNA的3'端,即基因组尾随(Tr)区的互补序列,起到反基因组启动子(antigenome promoter,AGP)的功能,但与GP(基因组启动子)不同,它只指导全长N-衣壳化cRNA的合成,而不指导非衣壳化RNA的合成。GP和AGP具有相似的组成,富含A和U,并且在狂犬病毒中,其最前端的11个核苷酸是完全相同的(3'-UGCGAAUUGUU…5')(Tordo et al., 1988; Tordo, Poch, Ermine, & Keith, 1986; Tordo, Poch, Ermine, Keith, & Rougeon, 1986)。这种末端互补性是MNV(单股负链病毒)基因组的共同特征,有力地证明了这些末端序列对启动子功能至关重要(Tordo et al., 1988; Whelan, Barr, & Wertz, 2004)。

图 2.3 狂犬病毒(RABV)基因组转录与复制产物示意图。
上方示意性地展示了狂犬病毒长约12 kb的基因组(vRNA),标明了五个开放阅读框(核蛋白N、磷蛋白P、基质蛋白M、糖蛋白G和RNA聚合酶或大蛋白L)(灰色部分)以及转录信号(黑色条块)。下方显示了vRNA序列的细节,包括末端序列以及N基因和L基因的转录信号(下划线)。5' 端加帽mRNA的转录是强制顺序进行的,从3' 端最靠近的N基因起始信号开始。在终止/多聚腺苷酸化信号处,聚合酶可以恢复转录邻近起始信号的下游基因,也可以从模板上解离,这导致了转录梯度的产生。位于终止/多聚腺苷酸化信号和重新起始信号之间的基因间区可能不被转录。复制过程涉及RNA被N蛋白同时衣壳化。正在延伸的前导RNA的不完全衣壳化可能导致在前导区/N基因边界处复制中止,或转为转录模式。狂犬病毒的反基因组cRNA是否也存在一个相应的调控产物(尾随RNA)尚不清楚。狂犬病毒的缺陷干扰RNA包含cRNA的5' 端和一个通过聚合酶反向复制新生的正链而形成的精确互补的3' 端。
3.2 狂犬病毒属病毒的基因
基因组的大部分(>99%)由蛋白质编码基因构成。它们由病毒聚合酶转录产生mRNA,并可由宿主细胞机制高效翻译。这些mRNA具有典型的5'端7-甲基鸟苷酸帽结构(m7G),有利于翻译起始。在所有狂犬病毒属病毒中,该序列始终以“5'-m7G-AACAYYNCU”开始,其中Y = C 或 U,N = 任意核苷酸。mRNA序列还具有非常短的5' 非编码区(通常只有20-30个核苷酸)和较长的3' 非编码区(通常在100-500个核苷酸之间)。在狂犬病毒的G蛋白mRNA中观察到一个特别长的3' 非编码区,它对应于基因组中最初被描述为假基因(Ψ)的区域。
基因之间在3' 非编码区长度的差异,是观察到的狂犬病毒属病毒基因组长度存在差异的主要原因。在狂犬病毒属病毒中,狂犬病毒(RABV)的基因组似乎最短,长度在11,923至11,932个核苷酸之间。其他狂犬病毒属病毒物种的基因组长度似乎略有增加,但总体差异仍然非常小。已报道最长的狂犬病毒属病毒基因组是西高加索蝙蝠病毒(WCBV)的,其长度也仅为12,178个核苷酸(Kuzmin, Wu, Tordo, & Rupprecht, 2008)。关于狂犬病毒属病毒基因组和蛋白质遗传变异性的更多细节,请参阅 Banyard, Hayman, Johnson, McElhinney, and Fooks (2011) 以及 Nadin-Davis and Real (2011) 的文献;另见本书第7章。
(未完待续)
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权威的大型学术专著《狂犬病(Rabies)》最新版已面世 (https://mp.weixin.qq.com/s/7v3fyBpGaHqHUZbZgPc3fw)
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