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Pydicom基础知识

已有 2635 次阅读 2019-6-12 10:47 |个人分类:Python|系统分类:科研笔记

  1. 在ubuntu上安装: conda install -c conda-forge pydicom

  2. 读取dicom并可视化

    import pydicom, os

    import matplotlib.pyplot as plt

    path = os.path.join(root, file)

    im = pydicom.dcmread(path)   # type of data is FileDataset

    px = im.pixel_array          # convert im to the type of numpy.ndarray

    plt.figure()

    plt.imshow(px)

    plt.show()          # do not forget this

  3.  关于DICOM预处理的很棒的网站:

        https://www.raddq.com/dicom-processing-segmentation-visualization-in-python/

4. 




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