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宏基因组Binning软件MetaBat2的安装与使用 2019-10-17
1. MetaBat2 的安装 按 MetaBat2 引文 提供的下载地址,从以下路径下载到最新版本的 MetaBat2 https://bitbucket.org/berkeleylab/metabat/down ...
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HiCPro接CscoreTools检测Compartment 2019-09-11
自 2009 年 Lieberman 及其合作者发明 Hi-C 技术至今, Hi-C 互作分析中 Compartmant 的主流检测方法一直是基于 PCA 降维后,用第一维度 ( 通常 ...
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HiCPro统计结果解读 2019-09-02
这篇博文是在我之前写的 《HiCPro 的安装与使用》 以及 《HiCPro 分析流程详解》 的基础上对统计结果进行解读。   因为博文过 24h 后 ...
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隐马尔科夫模型简介(四) 2019-08-08
本文接上一篇,继续探讨隐马尔科夫模型三个基本问题中最后一个问题,也是最复杂的一个问题。在此之前还是欢迎主角 HMM 登场! 3. 隐马尔科夫模 ...
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EM算法(期望最大化算法)简介 2019-08-01
和 HMM 简介一样(有关 HMM ,隐马尔科夫模型的简介,请参见我的另一篇博文 http://blog.sciencenet.cn/blog-2970729-1188964.html ),我们还是通 ...
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隐马尔科夫模型简介(三) 2019-07-15
本篇继续讨论隐马尔科夫模型的第二个基本问题——解码问题 在讨论之前,还是欢迎我们的主角——隐马尔科夫模型 (HMM) 出场!   Problem ...
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隐马尔科夫模型简介(二) 2019-07-15
本文接上篇继续讨论隐马尔科夫模型,上篇详见: http://blog.sciencenet.cn/blog-2970729-1188964.html 在讨论之前,欢迎我们的主角——隐马尔科夫模 ...
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隐马尔科夫模型简介(一) 2019-07-10
1. 一个简单的例子 假设我们想知道某个固定的地区一些年来的平均年平均气温。为了让这个问题变得有趣,我们假设我们关注的这些年份是在温度计发明之 ...
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