- A game between an individual and a population系列第三篇已经有了，但是这次想挑战一下自己，搞点模拟和计算，再查一下该引用的文献，准备向正规期刊投稿。希望在准备毕业论文的这段时间里能manage my time。 回复
- 原来pdf文件早就支持三维互动图像了，不过要用adobe自己的阅读器才能浏览。以后无论是出版业还是其它领域，如果人们之间能更加方便地传递、浏览三维互动图像，都应该是一个很值得期待的事情。 回复
- Finally got one paper accepted~ 回复
- Agent-based modelling... 两年前就见过这个名词了，当时却没放在心上，也没去查、学一下。这个东西或许早已包含了我正在思考的东西。不过也好，现在学还不晚。 回复
- 在量子物理学尚未完善的今天，我们要从复杂系统动力学里面找点东西来支持细胞发育生物学的研究，实在是过于乐观了。 回复
- proximate cause 和 ultimate cause: 近因，远因，终极因？ 2012-05-20
- Proximate cause 和 ultimate cause，字面上可译为“近因”和“终极因”，最近带实验课的时候才接触到。其实当年自己也学过相关的概念，但没有记住这两个名词。 ...
- A game between an individual and a population: rationale 2012-02-15
- 这是本系列的第二篇 (首发于本人 英文博客 )，对上一篇提出的想法作了更细致一点的介绍，并引出后面的话题。下一篇才是最重要的，先在此预告一下～ 201 ...
- A game between an individual and a population: Introduction 2012-02-06
- 前几天似乎想明白了点什么，仔细一想又不太明白。一些已经想通了的，先记在这里。后面的再继续想。（亦公布于本人 英文博客 。）其实跟先前的狼-羊博弈同属多层 ...
- 随记 关于dynamical systems与细胞生物学 2011-11-12
- 首先，我最近一年来所感兴趣的话题，应该算是dynamical systems理论。它需要一些网络理论作为基础，但不能算是后者的一部分。关于Kauffman的NK网络模型与Wolfr ...
- 阅读笔记：无标度布尔网络的动态 2011-10-31
- 刚刚读完 Maximino Aldana在2003年写的Boolean dynamics of networks with scale-free topology一文（ DOI:10.1016/S0167-2789(03)00174-X ）。之前学习到了Stua ...
- 随评：微小核糖核酸（microRNA）可通过食物进入人体 2011-09-22
- 南京大学张辰宇教授的研究组最近发现，一种来源于水稻的microRNA（MIR168a），可以经由人的消化系统进入血液循环。它如果进入肝细胞，能够对某个蛋白质（LDLRAP1 ...
- 随记 合成生物学01 2011-09-08
- 看到科网上宣传的盖茨基金大挑战，有些感兴趣。进去浏览了一下有关合成生物学（synthetic biology）的信息，于是看到下面这一段。（来源http://www.synberc.org/ ...
- 日记 —— 面试归来 2011-09-01
- 用英文写的，转自 这里 。 From last year I got interested in the relationship between cell reprogramming and gene regulatory networks (GRN). ...
- 《美丽心灵》观后 2011-07-17
- 今天在微博上假装看过这部电影，实际上只是久闻其名而已。不过随后还是完整地观看了一遍，过程那个惊悚……还好是个圆满的结局。 看到一半的时候，相信和多数观 ...
- Maxima 练习两则 2011-05-30
- 趁周日有空，试做了一下运动轨迹模拟。自己还算满意 不过要是把数组再搞明白一点，能把原代码写得再简洁一些就更好了。先上图。详情见 英文博客 。
- 让进化生物学帮忙：合成生物学实例一则 2011-05-22
- 先分享一篇新闻报道。 Directed evolution gets a significant speed boost 里面介绍了哈佛大学以及 Howard Hughes 医学院 Davied Liu 研究组的一项最近成果 ...
- 读书笔记：关于miRNA （一） 2011-05-02
- 本文亦发布于本人 英文博客 。 During the last two months I have read several papers on miRNAs. I noticed miRNAs because t ...
评注：Phylogeography之父John C. Avise访谈 2011-04-10- 刚刚看到黄晓磊老师发布的博文： Phylogeography之父John C. Avise访谈 。找到英文原文，对感兴趣的部分作了一下对照阅读。我现在就是做phylogeography的，对这个 ...
- R软件更新 2011-03-31
- 好久没用R，竟然也没注意应该升级到最新版了。 在windows下面比较好办，卸掉旧版，直接下载安装最新版即可。 在ubuntu下，添加源： http://ftp.heanet.ie/mirr ...
- 转译：如果不理牛顿那一套 2010-12-12
- 在普兰塔论坛闲逛的时候看到有网友推荐这篇奇文。转译过来供大家一乐。这篇冒牌论文是多年前几个生物学家用Nabi这个笔名合写的，意在讥讽当时某些生物学研究 ...
- Maxima练习一则 2010-12-04
- 大雪封门好几天，趁机练习了一下数学计算。 像dx1/dt=f(x1,x2); dx2/dt=g(x1,x2)这种形式的模型，原来只需要Maxima里面的plotdf函数就可以将其图像化了。 以下 ...
