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简单实用的在线维恩图绘制方法
热度 1 刘洪波 2018-10-1 00:18
第一步:登入 http://bioinfogp.cnb.csic.es/tools/venny/index.html ,将各组数据输入到相应的list;计算各组数据的重叠,并绘制圆圈大小相同的维恩图;直接下载可用。 第二步:如果想根据各组数据和重叠的个数调整圆圈大小,登入 http://www.cs.kent.ac.uk/people/staff/pj ...
个人分类: 科研经验|8777 次阅读|2 个评论 热度 1
VM VirtualBox两虚拟机间实现数据同步传输
刘洪波 2018-10-1 00:13
测试环境: Win8+VM VirtualBox 4.3的两个Ubuntu64虚拟机 1、虚拟机采用Host-Only网络 Host-Only的宗旨就是建立一个与外界隔绝的内部网络,来提高内网的安全性。 一个虚拟机:192.168.56.101,另一个为:192.168.56.102 2、现要实现将192.168.56.101中/var/lib/mysql/hg19对拷到192.168.56.102的对应目录中。 ...
个人分类: 科研经验|1462 次阅读|没有评论
更改mysql目录的操作
刘洪波 2018-10-1 00:13
近期由于工作需要,发现在linux中默认安装在/var/lib/mysql的数据库太大了,且占用了大量的根目录空间,由于对mysql目录进行了转移。首先将文件复制到一个较大的空间,然后利用软连接来修改默认访问/var/lib/mysql的转向。无需进行额外操作,即可完成mysql数据库文件的转移。 cp -aR /var/lib/mysql/. /pub3/mysq ...
个人分类: 科研经验|882 次阅读|没有评论
关于发布Python软件包
刘洪波 2018-10-1 00:04
1. 首先编写 setup.py文件 参考 http://blog.csdn.net/ponder008/article/details/6592719 2.安装setuptools https://pypi.python.org/pypi/setuptools/ Windows安装 (Invoke-WebRequest https://bootstrap.pypa.io/ez_setup.py).Content | python - Linux下安装Sedtools wget https:/ ...
个人分类: 科研经验|1066 次阅读|没有评论
生物信息学技术 之 如何进行物种间同源序列分析
刘洪波 2018-9-30 23:31
随着生命科学的发展,人们越来越关注基因或调控元件的物种间保守性,如何获取这些同源序列则成为生物信息学分析的常见内容。现将这方面的经验总结如下,希望对大家有所帮助! 图文并茂版 ,请下载: 获取同源序列的步骤.pdf 纯 文字版 : gi|341926217 ...
个人分类: 科研经验|2472 次阅读|没有评论
Install python package without root (pip安装到指定目录)
刘洪波 2018-9-30 23:26
_______________ 方法1 (亲测有效)_______________ pipinstall--userpackage _______________ 方法2 _______________ pipinstall--install-option=--prefix=$HOME/localpackage _______________ 方法3 _______________ 用户 ...
个人分类: 科研经验|2092 次阅读|没有评论

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