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Use R: 画泰勒图 Taylor Diagram,模型比较一目了然
庄伟 2020-10-14 22:54
IPCC推荐的模型评价方法: 在做模型相关的工作时,我们经常会需要比较模拟效果。当使用多个模型时,看那个模型的模拟效果更好些,模拟误差更小,仅仅画散点图进行比较是不直观的。Taylor Diagram 泰勒图是一种可以直观进行模型比较的方法。它巧妙利用三角函数几何原理,把三种评价模型的指标在一张图上展现。IPCC的报告 ...
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USE R 画出散点密度图
热度 1 庄伟 2019-11-6 16:24
有三种方法 一种如下: 可以用第一个文件中的代码生成图例。这样方法用R里面基本的画图功能,有些格式要自己调整。图例不能自己生成,需要出图后,自己修改。 r_scatter_density_plot.R 这是第二种方法 借助ggplot 不过这个示例中,如何画出图例,需要思考一下,有待解决 r_scat ...
个人分类: R|1292 次阅读|2 个评论 热度 1
Penman-Monteith模型模拟蒸散R代码示例
庄伟 2019-10-28 09:34
运行代码在下方zip附件中,请下载:) PM_HowardSprings_20190918.zip
个人分类: R|1049 次阅读|没有评论
Century 模型 R代码分享
庄伟 2019-8-30 13:45
Century 是传统的土壤碳过程模型,这里分享本人最近找到的三个相关版本: 1. Fortran 版本(linux) 该版本的下载地址: https://github.com/bsulman/INTERFACE-model-experiment-synthesis DAYCENT.zip Sulman et al (2018)发表了多个土壤碳模型比较的文章,并分享了部分模型的代码,century的源代 ...
个人分类: R|1806 次阅读|没有评论
USE R: SCEUA优化方法进行Shuttleworth-Wallace 模型的参数优化
庄伟 2019-7-9 17:02
sceua_SW.zip 分享一个SCEUA进行参数优化的例子,模型是Shuttleworth-Wallace 模型,其中的冠层导度子模型采用自Leuning et al. (2008) WRR. 用到了Ozflux一个站点的数据,数据为白天的日均值,优化的参数是最大气孔导度gmax,和土壤表面阻力有关的参数b3。感兴趣的老师同学可以看看。这里写的R代码是在j ...
个人分类: R|1374 次阅读|没有评论
气孔导度单位换算 更正
庄伟 2019-7-4 22:57
气孔导度(stomatal conductance)是计算植被蒸散常用的变量。气孔导度的单位,气象中一般采用mm s -1 (或者 m s -1 ),生理生态中一般采用 mmol m -2 s -1 (或者mol m -2 s -1 )。从m s -1 到的mol m -2 s -1 单位换算,需要乘以摩尔体积的倒数(1/V m , mol m -3 )。 根据下图的理想 ...
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【code分享】 USE R: 参数的全局优化算法
庄伟 2019-5-23 20:04
Shuffled Complex Evolution (SCE-UA) Method SCE-UA, 是一种全局优化算法, 它结合了随机搜索算法、单纯形法、聚类分析及生物竞争演化等多种方法的优势,能有效解决目标函数反映面存在的粗糙、不敏感区及不凸起等问题,并可避免局部最小点的干扰 。该方法能够同时优化模型中的多 ...
个人分类: 科研工具|1790 次阅读|没有评论
ggplot画图时间坐标轴显示英文格式的方法
庄伟 2019-4-17 15:14
发表在国际期刊的论文,一般要求图中的坐标都是英文。用R画图时,输出时间坐标轴有时会用中文时间来显示,用下面的命令,可以把输出的语言变成英语: Sys.setlocale(LC_TIME, English)
个人分类: R|1901 次阅读|没有评论
论文写作:6000+期刊的Endnote 参考文献格式的官方下载
庄伟 2019-4-14 19:25
https://endnote.com/downloads/styles/ 在这个endnote的官网可以下载6000+期刊的Endnote 参考文献格式,对写文章的老师同学很有用。可以搜索你需要的期刊的。 也可以全部下载,下载后的压缩文件16.1M,解压后,可以找你您需要的期刊格式(.enw),双击后在ENDNOTE中打开,然后另存为即可。
个人分类: 科研工具|12874 次阅读|没有评论
jupyter lab:交互式的编程环境,它可以帮助我们完成一个完成的实验报告
庄伟 2019-3-9 16:45
Jupyter lab 是Jupter Notebook的升级版。 它继承了Jupyter Notebook的优点:将可执行的代码、描述性文本(Markdown)、方程(LaTex)、图片、交互式可视化和运行输出结果等整合显示到一个笔记本文件中。 Jupyter lab可以配置R、Python等运行环境。 以下是官网对Jupyter lab的介绍视频 https://jupyterlab.read ...
个人分类: R|2010 次阅读|没有评论

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GMT+8, 2020-10-22 09:34

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