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Gaussian的IRC计算的常用关键词
丁迅雷 2018-5-4 08:08
# b3lyp/def2tzvp geom=allcheck guess=read IRC(rcfc,recalc=5,stepsize=30,LQA,maxpoints=100,Reverse) 或者IRC(rcfc,recalc=5,stepsize=5,LQA,maxpoints=100,Forward) 注意stepsize是IRC的步长(默认是10,为0.1bohr),不要和优化结构时使用的步长参数 maxstep混淆了。 细节参考sob大神的 http://s ...
个人分类: Gaussian|10823 次阅读|没有评论
我的vasp学习笔记
丁迅雷 2017-6-29 09:44
在自己学习VASP的过程中,做了一些笔记,仅供大家参考,希望对初学者有所帮助。文档目前内容还比较少,会不断更正和更新。 特别提醒: 网上VASP的资料很多,初学者在使用的时候,一定要抱着一个怀疑的态度,一些可以测试的东西,最好自己测试一下。我这里写的虽然大部分都是亲测,但是系统不一样、环境不一样、版本不一 ...
个人分类: vasp|4446 次阅读|没有评论
JPCA: H2 on AuV2O5+
丁迅雷 2017-5-10 16:17
和化学所合作的一篇论文,感谢何老师的支持,感谢张岩同学。 另外赞一下JPCA的速度。 关键词:贵金属;单原子催化;团簇模型;质谱;DFT;反应机理 H2 Oxidation Mediated by Au1-Doped Vanadium Oxide Cluster Cation AuV2O5+: A Comparative Study with AuCe2O4+ Yan Zhang, Zi-Yu Li, Yan-Xia Zhao, Hai-Fan ...
个人分类: 我的论文|3331 次阅读|没有评论
NH3+HNO3 气相分子团簇的理论计算 (JPCA)
丁迅雷 2017-2-1 08:43
很高兴能和科大的两位老师(分别是我的导师和同学)和一位研究生合作做了一个小工作,并最终成文发表。 本文研究了(NH3)m(HNO3)n (其中n,m=4)以及大一点的(NH3)m(HNO3)m (其中5=m=8)。 酸碱体系中,H+转移非常普遍。体系中不同氢键的强弱差异很大,分子团簇的构型搜索需要特别的耐心。 文章的投稿日期和在 ...
个人分类: 我的论文|3960 次阅读|没有评论
金团簇吸附氧原子的工作 (PCCP)
丁迅雷 2016-9-27 20:50
10多年前做过金团簇上吸附氧气分子的工作,也是我被引最多的工作了。 不过很奇怪的,单个氧原子的吸附却一直没人做,大概是觉得太过简单了吧。 合肥物质科学研究院的黄伟老师,在AunX方面做过一系列漂亮的工作。 本文系统研究了小团簇体系 AunO,算是一个小的补充。 很高兴文章被接收,以下是网址: http://pubs. ...
个人分类: 我的论文|4703 次阅读|没有评论
def2-tzvp基组加弥散的方法,弱相互作用计算
丁迅雷 2016-8-24 11:21
量化大神sobereva的帖子(http://bbs.keinsci.com/forum.php?mod=viewthreadtid=3487extra=)指出: Truhlar等人提出一种通用的给出原本不含弥散函数的基组以最低限度的弥散函数的策略,这样的基组以ma-开头,含义是minimal augmentation,详见J. Chem. Theory Comput., 7, 3027、Theor. Chem. Acc., 128, 295 ...
个人分类: Gaussian|21776 次阅读|没有评论
氧化钒团簇上单个Au或Ag原子的吸附(与单原子催化有点关系)
丁迅雷 2016-3-8 19:27
通过对不同电荷的V3Oy团簇上Au和Ag吸附的比较研究,得出了一些简单规律。 例如Au可以吸附在V或者O上,且吸附能都比较大,而Ag更倾向于吸附在O上。 贵金属单原子的吸附研究为 进一步研究 单原子催化剂的稳定性和活性打下了基础(也是我们继续研究的内容)。 文章标题:Adsorption of a single gold or silver a ...
个人分类: 我的论文|3618 次阅读|没有评论
关于甲烷活化的一篇论文发表
丁迅雷 2015-10-1 10:23
标题: High reactivity of nanosized niobium oxide cluster cations in methane activation: A comparison with vanadium oxides J. Chem. Phys. 143, 124312 (2015); http://dx.doi.org/10.1063/1.4931972 在线发表一个月内免费下载(这个比较好,可以可能的增加下载量)。 以下为论文投 ...
个人分类: 我的论文|11482 次阅读|没有评论
用google在指定网站查英语句子
丁迅雷 2015-8-29 17:26
论文写作中,对一些句子不大有把握。例如,“ by a factor of 10”还是 “ by a factor of ten”? 直接用google搜索,可以知道前者用得更多。 但是有人指出,google直接查到的英语用法,很多是非英语国家的人写的,还有些是科技英语里面出现的,所以可能不一定是正确的(或地道的)。 为了确认,可以 ...
个人分类: English学习|4141 次阅读|没有评论
过渡态能量比中间体还低(negative TS)
丁迅雷 2015-1-19 13:05
理论计算时,会遇到这样的问题: 不考虑零点能时,得到了过渡态TS,能量比中间体稍高(如果这时还低那就不合理了), 但考虑了零点能之后,TS能量比中间体还低(当然也不会低太多)。我叫它 negative TS。 这有两种可能:1.实际上有TS,但计算方法的问题造成的,2. 实际上没有TS。 无论哪种情况,有一点是明确的,即这 ...
个人分类: 我的论文|11424 次阅读|没有评论

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