发育系统生物学之Nature Methods上的一篇论文

Gene-pair expression signatures reveal lineage control

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中文题目和摘要：

基因对 表达信号揭示了怎样控制细胞分化

Gene-pair expression signatures reveal lineage control

摘要： 多细胞生物中的不同细胞类型的出现是由于基因组中基因的集体表达所形成的基因调控网络造成的，这种基因调控网络会产生自稳态或吸引子。我们收集了由166种细胞类型和2602个转录调控基因构成的人类基因表达数据，发展了一种用于识别细胞命运决定因素的数据驱动方法，这种方法基于概念“表达相反的基因对(expression reversal of gene pairs)”，比如参与开关回路的哪些基因。这种方法能够把细胞类型组织成个体发育的谱系关系。我们的方法还能鉴定出控制神经元命运、多能性和血细胞分化的调控回路中的基因，且能用于给细胞命运反转因子排序。

Nature Methods上的原文：

http://www.nature.com/nmeth/journal/v10/n6/full/nmeth.2445.html