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Perl代码| 读书随想| 论文阅读| 生物信息学| 方法总结| troubleshooting|

怎样判断newick格式的进化树是有根树，还是无根树？: 热度 1 李雷廷 2015-10-9 09:52; ［有时通过构建进化树的软件获得进化树后，软件不会对进化树是有根树，还是无根树做说明。在不做额外编写脚本的基础上，其实可以直接从newick文件的内容格式上区分有根树和无根树］假设有下面三种形式的进化树： (a, b, c); 无根树 (a, b, c):1; 有根树 ((a,b),c); ...; 20011 次阅读|1 个评论热度 1

Linux下利用Find命令查找大文件的方法: 李雷廷 2015-10-8 15:53; ［Linux下的Find命令具有很强大的功能，合理利用可以节省额外编写脚本的时间。］利用find命令查找大于某个标准的文件并利用ls命令列举出来： find {/path/to/directory/} -type f -size +{size-in-kb}k -exec ls -lh {} ; 上述命令的-type f的意思只查找文件，忽略文件夹等其它类型，-size是确定文件大小， ...; 3504 次阅读|没有评论

利用云存储时时备份你的重要数据: 热度 1 李雷廷 2015-9-29 00:18; 不止一次的听说这样的悲剧：电脑坏了硬盘读不了数据了，修改的论文没了，只能从邮箱里找一个旧的版本，重新来过。重要的数据要备份，这是现在的研究生必须具备的一个常识。那么问题来了，怎么备份呢？主要有两种方式：硬盘备份云存储备份如果你用的OS X操作系统，请注意你电脑上的Time Machine那个软件， ...; 3559 次阅读|1 个评论热度 1

怎样做一个自己实验室的网站（三）DNS和CDN: 李雷廷 2015-9-27 21:12; 假设你自己申请了一个域名，在你自己的服务器（购买的VPS或自己实验室的服务器）上利用Wordpress之类的内容管理系统做了一个网站，下面需要考虑的就是 DNS (Domain Name Server)和 CDN (Content Diliver network)。 DNS（域名系统）的作用是把域名和网页服务器关联起来，也就是用来指定一个域名的真实服务器地址。在购买 ...; 3387 次阅读|没有评论

怎样做一个自己实验室的网站（二）域名: 热度 1 李雷廷 2015-9-26 17:42; 要做一个自己实验室的网站，除了要考虑内容存储和网站建设，还要考虑网站的网址。因为网址一旦确定，一般不做修改，否则不利于搜索引擎检索。首先介绍一下网址的组成：三级域名.二级域名.顶级域名/网站内容地址。常用的顶级域名是.com, .org, .net等，一般个人可以付费注册除edu和gov的任意二级域名。除了被人注册过 ...; 6156 次阅读|1 个评论热度 1

中美实验室名称对比: 热度 3 李雷廷 2015-9-24 16:16; 美国科学家的实验室名称有一个特点，好多都是用PI的姓作为实验室的名称的，比如庄小威教授的实验室叫Zhuang Research Lab ( http://zhuang.harvard.edu )；刘小乐教授的实验室名字叫X. Shirly Liu Lab（ http://liulab.dfci.harvard.edu ），或者简称Liu Lab；龙漫远教授的实验室名称为The Manyuan Long Laboratory（ http ...; 13623 次阅读|3 个评论热度 3

怎样做一个自己实验室的网站（一）: 李雷廷 2015-9-23 15:59; 用Google/Baidu直接搜索科学家的名字，一直有一个感觉，就是美国的教授们特别喜欢做一个自己实验室的网站，列举出来自己实验室的主要研究方向、人员、发表论文列表、联系方式，如果需要招人有时还挂上招聘广告。相对的，包括中国在内的其它国家的教授们就不是特别喜欢做自己实验室的网站。当然，这些年中国的信息化程度在 ...; 9479 次阅读|没有评论

科学网检测移动设备漏洞: 热度 1 李雷廷 2015-9-14 14:53; 最近好长一段时间打开科学网都能在科学网顶部看到一个提示：“ 检测到您正在使用移动设备浏览，点击此处浏览科学网手机版，访问更加流畅。 ” 而事实上，我用的是苹果笔记本电脑（OS X 10.10.4，Safari浏览器），非手机或平板电脑。这是一个明显的检测错误，看着特别碍眼。不知道科学网是因为操作系统而导致误判， ...; 2364 次阅读|2 个评论热度 1

Linux/BSD下join命令使数据以tab为分隔符的方法: 李雷廷 2015-9-4 14:07; ［join命令可以通过-t $'t'来把分隔符设为tab字符］默认情况下，Linux/BSD下的join命令以空格为分隔符。即使你的输入文件是以tab为分隔符的，输出文件也会变成以一个空格为分隔的文件。假如你的数据中存在有空格的字符串，输出结果就会变得混乱，比如： file1.txt a hello b ...; 6715 次阅读|没有评论

在github中删除已经同步过的commit: 李雷廷 2015-8-5 10:36; git的流行和功能强大是毋庸置疑的，然而理解git的原理和掌握git的用法却不那么容易。要删除已经同步的commit需要两步，第一步是从本地删除已经commit，利用命令： git reset --soft HEAD~1 删除最近的一个commit 然后将本地的HEAD文件强制覆盖github上的HEAD文件 git push origin HEAD --force 参考 ...; 5140 次阅读|没有评论

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