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intel编译器的安装
宋永顺 2018-10-25 10:20
intel 编译器的安装: 2017 update5 链接: https://pan.baidu.com/s/1qvHSvnXqUIZfkNfbihKAcA 密码:oq7h 在centos 6.4上安装成功。update4不成功,卡住 checking那步 不走。 但在centos 5.3上安装不成功。 安装成功后,运行出现error: Error: A license for Comp-CL is not available 解决办法: https ...
个人分类: 计算机|11483 次阅读|没有评论
gromacs下力场参数
宋永顺 2018-10-10 11:48
为什么 gromacs 里的相互作用参数那么大? 以 C-CA 为例:amber 96力场下为392459.2 kJ/mol/nm^2 换算成 Å  ,也有3924.6 kJ/mol = 934 kcal/mol/Å 2 原因是,其实还要乘 1/2. 因为原始能量函数中没有 1/2: https://pubs.acs.org/doi/pdf/10.1021/ja00124a002 & ...
个人分类: 分子模拟|4057 次阅读|没有评论

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