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VASP计算中ISMEAR取值的官方注意事项
郭令举 2024-3-22 10:01
VASP进行计算时,ISMEAR选项是一个比较重要的参数,关系到能量的计算准确性, 缺省值为1,并不能适合所有的情况。 VASP官方wiki关于ISMEAR设置的比较长: https://www.vasp.at/wiki/index.php/ISMEAR 简要的学习笔记记录如下,仅供参考: 1、 结构优化 明知是金属 : ISMEAR =&nbs ...
个人分类: 第一性原理(vasp)|913 次阅读|没有评论
VASP计算过渡态(CI-NEB)初始结构生成脚本汇总
郭令举 2024-3-12 21:42
Script for Generating Initial Structures in VASP Calculations of Transition States (CI-NEB) 使用VASP计算过渡态,最重要的步骤就是在得到了初态和末态结构之后,进行反应路径的插值,插值的优劣直接关系到后面的过渡态搜索的难易。现在把常用的插值脚本和使用方法,特别是在ase出现以后的i ...
个人分类: 第一性原理(vasp)|1130 次阅读|没有评论
ISMEAR取值
郭令举 2023-10-9 21:36
If you have no a priori knowledge of your system, for instance, if you do not know whether your system is an insulator, semiconductor or metal then always use Gaussian smearing ISMEAR =0 in combination with a small SIGMA =0.03-0.05. This is not the default in VASP yet, so to be o ...
个人分类: 第一性原理(vasp)|1114 次阅读|没有评论
VASP计算不收敛的解决方法
郭令举 2023-4-23 10:40
有些帖子已经总结的很好了,可以根据自己遇到的情况直接拿来用。如果把这些方法都用了还是不行,恐怕是你的结构本身问题较大了。 帖子1: https://blog.shishiruqi.com//2019/05/01/scf/ 帖子2: https://www.bilibili.com/read/cv21448185 官方 : https://www.vasp. ...
个人分类: 第一性原理(vasp)|1625 次阅读|没有评论
2023包含材料理论计算的国内会议汇总
郭令举 2023-4-8 11:04
一、 会议名称 : 第五届平面波密度泛函材料模拟大会 会议网址: https://www.koushare.com/lives/room/635227 召开时间: 2023年3月25日 会议地点:福建 省厦门市 主办单位: 北京龙讯旷腾科技有限公司 二、 会议名称: 中国化学会2020年软物质理论计算与模拟学术会议 ...
个人分类: 第一性原理(vasp)|4168 次阅读|没有评论
去除INCAR中的^M字符
郭令举 2022-5-5 18:07
近期帮朋友做个测试,用他给我的 INCAR ,提交到 GPU 节点会有如下报错,提交到 CPU 节点没啥问题。 用 vi 看下 INCAR 文件,都是一些常规的选项,没有什么特别的。 但是 OUTCAR 里发现有好多的^M字符。 用 cat -A INCAR 查看一下 INCAR : 的确有不少 ^M,NEDOS 后面就有。 在网 ...
个人分类: 第一性原理(vasp)|1987 次阅读|没有评论
ase gui输出格式的修改
郭令举 2020-11-23 14:47
上篇博文提到使用ase gui保存新的POSCAR时,POSCAR的格式是VASP.4.*的格式。 缺 少一行元素名称项。 而且保存的坐标文件也是Cartesian格式的坐标。 可以通过修改ase文件中vasp.py文件来解决这个问题。 这个文件在什么地方呢? 1、如果 ...
个人分类: 第一性原理(vasp)|3632 次阅读|没有评论
VASP 固定POSCAR中部分原子的四类方法
郭令举 2020-11-21 14:47
一、概述 VASP计算中为了节约机时,加快计算速度,经常会采取固定一部分原子的策略来实现。 VASP的结构信息存放在名为POSCAR的文本文件中。一般的POSCAR文件如图1所示: 图1、默认的POSCAR文件格式 如果要固定某些原子,则需要在这个文本文件中加入一行Selective dynamics,以及每个原子坐标后面需 ...
个人分类: 第一性原理(vasp)|21847 次阅读|没有评论

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