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[转载]利用SpG和SpRY变体 极大拓展水稻基因组编辑范围 2021 SCLS

已有 1240 次阅读 2022-10-18 13:26 |系统分类:科研笔记|文章来源:转载

CRISPR/Cas9技术自问世以来因其强大、高效、便捷的特点得到迅速发展和广泛应用,大大加快了植物功能基因组研究和种质资源创新进程。然而,天然的SpCas9蛋白精准识别基因序列受限于一段NGGNAG PAM (Protospacer adjacent motif) 的邻近核苷酸序列。中国农业科学院/中国水稻研究所王克剑团队和中国科学院遗传与发育生物学研究所李家洋团队长期致力于植物基因组编辑工具开发工作,合作发展了一系列SpCas9的变体(SpCas9-VQR, SpCas9-VRER, xCas9)以及同源蛋白(ScCas9),将PAM由经典的NGGNAG拓展为只受一个G的限制,但依然无法做到不受PAM的限制。


近日,Science China Life Sciences 在线发表了王克剑团队和李家洋团队题为“Expanding the scope of genome editing with SpG and SpRY variants in rice的合作研究论文。该研究发现,SpG变体在水稻中可有效地识别NGN PAM并具有较高的基因编辑效率。SpRY变体近乎不受PAM序列的限制,但是其对NNRNRN PAMR=A/G)具有偏好性


为了检测SpGSpRY这两种变体在水稻中的基因编辑情况,研究团队分别在水稻愈伤组织和植株中对SpGSpRY分别识别NGN NNN PAM的基因编辑情况进行了检测。研究结果显示,SpG变体在水稻中可有效地识别NGN PAM并具有较高的基因编辑效率。SpRY变体在PAM的识别上具有明显地偏好性,即NRN>NYN。并且相较于传统的SpCas9SpRY变体更容易产生较大片段(>3bp)的缺失。以上研究结果表明,SpGSpRY变体极大扩展了水稻基因组的可编辑范围,几乎不再受到PAM的限制,为后续植物功能基因组的研究和作物改良提供了技术支撑。

Expanding the scope of genome editing with SpG and SpRY variants in rice2021-1-16.pdf

 

中国水稻研究所博士研究生任俊、遗传发育所副研究员孟祥兵、水稻所硕士研究生胡风越为该论文的共同第一作者,水稻所王克剑团队的王春研究员和遗传发育所李家洋团队的余泓副研究员为该论文的共同通讯作者,扬州大学严长杰教授也参与了研究工作。该项研究得到国家转基因专项和中国农科院创新工程经费资助。

 

论文链接:

http://engine.scichina.com/doi/10.1007/s11427-020-1883-5




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